The Rise of CRISPR/Cas for Genome Editing in Stem Cells

Shui, Bing; Matias, Liz Hernandez; Guo, Yi; Peng, Ying

doi:10.1155/2016/8140168

Cited by 26 publications

(21 citation statements)

References 143 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Under a basal physiological condition, the shear force level was approximately 0.64 dyn/cm 2 in a collecting lymphatic vessel (45), 0.001 dyn/cm 2 in mouse tail capillaries (46), and 0.003 dyn/cm 2 in human skin capillaries (47). Compared with these very low shear force levels, however, conceptual predicnology (43) and studied the impact of genetic ablation of Dtx3l on embryonic lymphatic development. Dtx3l KO mice apparently are fertile and grossly normal until 4-6 months of age, after which they tend to become unhealthy and die much earlier than their WT littermates.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Laminar flow downregulates Notch activity to promote lymphatic sprouting

Choi

Park

Jung

et al. 2017

Journal of Clinical Investigation

117

122

View full text Add to dashboard Cite

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Laminar flow downregulates Notch activity to promote lymphatic sprouting

Choi

Park

Jung

et al. 2017

Journal of Clinical Investigation

117

122

View full text Add to dashboard Cite

“…The promise of gene therapy for CAMT and other hereditary hematologic disorders awaits successes in the rapidly advancing field of genome editing of patient-derived stem cells. 17,30 Because only a subset of hematopoietic progenitor cells may need to be edited to achieve long-term polyclonal hematopoiesis, this approach could represent a cure for the majority of CAMT patients.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

“…Currently, HSC transplantation is the only curative option for pediatric patients with life-threatening CAMT. 15,16 We show that CRISPR-Cas9 gene editing methods 17 could be used to correct abnormalities in the MPL gene.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 92%

Gene editing rescue of a novel MPL mutant associated with congenital amegakaryocytic thrombocytopenia

et al. 2017

View full text Add to dashboard Cite

Key Points• We report unique familial cases of CAMT presenting with a novel MPL W272R mutation in the background of the activating MPL K39N mutation.• Function of mutant Mpl receptor can be rescued using 2 approaches: autophagic cell surface delivery and CRISPR-Cas9 gene editing.Thrombopoietin (Tpo) and its receptor (Mpl) are the principal regulators of early and late thrombopoiesis and hematopoietic stem cell maintenance. Mutations in MPL can drastically impair its function and be a contributing factor in multiple hematologic malignancies, including congenital amegakaryocytic thrombocytopenia (CAMT). CAMT is characterized by severe thrombocytopenia at birth, which progresses to bone marrow failure and pancytopenia. Here we report unique familial cases of CAMT that presented with a previously unreported MPL mutation: T814C (W272R) in the background of the activating MPL G117T(K39N or Baltimore) mutation. Confocal microscopy, proliferation and surface biotinylation assays, co-immunoprecipitation, and western blotting analysis were used to elucidate the function and trafficking of Mpl mutants. Results showed that Mpl protein bearing the W272R mutation, alone or together with the K39N mutation, lacks detectable surface expression while being strongly colocalized with the endoplasmic reticulum (ER) marker calreticulin.Both WT and K39N-mutated Mpl were found to be signaling competent, but single or double mutants bearing W272R were unresponsive to Tpo. Function of the deficient Mpl receptor could be rescued by using 2 separate approaches: (1) GRASP55 overexpression, which partially restored Tpo-induced signaling of mutant Mpl by activating an autophagy-dependent secretory pathway and thus forcing ER-trapped immature receptors to traffic to the cell surface; and (2) CRISPR-Cas9 gene editing used to repair MPL T814C mutation in transfected cell lines and primary umbilical cord blood-derived CD34 1 cells. We demonstrate proof of principle for rescue of mutant Mpl function by using gene editing of primary hematopoietic stem cells, which indicates direct therapeutic applications for CAMT patients.

show abstract

“…Vektörleri CRISPR-Cas dizisinin kodlandığı nükleik asit iskelet yapısını temel alarak, v vi ir ra al l ve p pl la az zm mi it t vektörler olarak iki temel grupta incelemek mümkündür. 24 Vildan BOZOK ÇETİNTAŞ ve ark.…”

Section: Crispr-cas9 Si̇stemi̇ni̇n Transfeksi̇yon Ve Taşinma Strateji̇leri̇unclassified

From the Immune Response to the Genome Design; CRISPR-Cas9 System: Review

Çetintaş¹,

Kotmakçı²,

Kaymaz³

2017

Turkiye Klinikleri J Med Sci

View full text Add to dashboard Cite

Tur ki ye Kli nik le ri J Med Sci 2017;37(1):27-42 BAĞIŞIKLIK SİSTEMİ OLARAK CRISPR-CasPatojenler, özellikle virüsler, gelişmiş canlılarda olduğu kadar tek hücreli canlılar için de tehdit oluş-turmaktadır. Bu bakımdan tek hücreli canlıların da virüslere karşı genomlarını korumak için bir savunma sistemine sahip olmaları gerekmektedir. Yirmi yıl öncesine kadar, bakterilerin bağışıklık sistemi olarak sadece doğal restriksiyon enzimlerine sahip olduğu biliniyordu. Ancak son yıllarda yapı-lan çalışmalarda, bakterilerin de karşılaştıkları patojenlere karşı kazanılmış bağışıklık sistemi geliştirebildikleri gösterildi. Günümüzde CRISPRCas olarak adlandırılan bu sistemin arkelerin %84'ünde ve bakterilerin ise yaklaşık %45'inde bulunduğu bilinmektedir. 1Prokaryot canlılarda "d dü üz ze en nl li i a ar ra al lı ık kl la ar rl la a b bö ö--l lü ün nm mü üş ş k kı ıs sa a p pa al li in nd dr ro om mi ik k t te ek kr ra ar r k kü üm me el le er ri i" (CRISPR: clustered regularly interspaced short palindromic repeats) adı verilen belirli DNA bölge-leri kazanılmış bağışıklık sisteminin temelini oluşturmaktadır.2,3 CRISPR bölgelerinin tekrarlayan palindromik dizileri ilk olarak Ishino ve ark. tarafından Escherichia coli'de Apoptoz inhibitör protein (IAP: The inhibitory of apoptosis protein) gen dizisi çalışılırken bulunmuştur. 4 IAP geninin dizi analizi sırasında, aşağı akış bölgesinde 29 nük-leotit (nt) tekrar kümeleri ve bu tekrarların arasında 32 nt ara DNA bölgeleri belirlenmiş ancak fonksiyonları anlaşılamamıştır. Sonraki yıllarda yapılan çalışmalar tekrarlayan DNA bölgelerinin çok sayıda bakteri ve arkelerde bulunduğunu, ayrıca bu bölgelerdeki DNA dizilerinin plazmitler, transpozonlar ve bakteriyofajlar gibi ekzojen mobil genetik elementlerle özdeş olduğunu göstermiştir. 5Biyoinformatik analizler CRISPR bölgelerinin, yakınlarında bulunan C Ca as s (CRISPR associated) genleri ile ilişkili olduğunu göstermekle birlikte, birçok Cas geninin nükleaz ve helikaz gen ailelerine benzer diziler içerdiğinin keşfedilmesini sağlamış-tır.3 Bu bulgular CRISPR/Cas sisteminin RNA-aracılı bir savunma sistemi olabileceği hipotezini ortaya çıkartmıştır. Bu hipotez Barrangou ve ark.nın 2007 yılında yapılan çalışmasında doğru-lanmış, CRISPR sekanslarının ve ilişkili Cas proteinlerin bakteriyofaj enfeksiyonuna karşı müdahale yönelttiğini kanıtlamıştır.2 Son 10 yılda RNA-aracılı müdahale olarak CRISPR/Cas mekanizması büyük oranda aydınlatılmıştır.CRISPR bölgelerinin en belirgin özelliği, içer-dikleri tekrarlayan kısa DNA dizileridir (Şekil 1). Palindromik olan bu kısa DNA bölgeleri 5'den 3'e ve 3'den 5'e, her iki yönde de aynı okunan dizilerdir. Palindromik DNA dizi tekrarlarının arasında ise aralayıcı (spacer) adı verilen DNA bölgeleri bulunur. Özgün DNA dizilerinden oluşan aralayıcı bölgeler, kazanılmış bağışıklık sisteminin belleğini oluşturan temel öğelerdir. Bu bölgeler genellikle bir virüsün veya plazmitin nükleik asitlerinden prokaryot genomuna alınır. Prokaryot bir organizma aynı virüs ile tekrar karşılaştığında ise aralayıcı diziler tan...

show abstract

The Rise of CRISPR/Cas for Genome Editing in Stem Cells

Cited by 26 publications

References 143 publications

Laminar flow downregulates Notch activity to promote lymphatic sprouting

Laminar flow downregulates Notch activity to promote lymphatic sprouting

Gene editing rescue of a novel MPL mutant associated with congenital amegakaryocytic thrombocytopenia

From the Immune Response to the Genome Design; CRISPR-Cas9 System: Review

Contact Info

Product

Resources

About