The proteome of maritime pine wood forming tissue

Gion, Jean‐Marc; Lalanne, Céline; Provost, Grégoire Le; Ferry-Dumazet, Hélène; Paiva, Jorge A P; Chaumeil, Philippe; Frigério, Jean‐Marc; Brach, Jean; Barré, Aurélien; Daruvar, Antoine de; Claverol, Stéphane; Bonneu, Marc; Sommerer, Nicolas; Négroni, Luc; Plomion, Christophe

doi:10.1002/pmic.200401197

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“…Deste modo, um dos desafios da genética e fisiologia vegetal é elucidar as funções e os mecanismos de regulação dessas reações alternativas (PLAXTON, 1996 , 1988). Trabalhos têm identificado transcritos e proteínas relacionados à fermentação alcoólica em espécies arbóreas, incluindo E. grandis (GION et al, 2005, JUAN et al, 2006, CELEDON et al, 2007 Considerando a grande interconexão entre estas três vias, um ponto de extrema importância no estudo do controle metabólico é a análise do sistema como um todo.…”

Section: Respiração Vegetalunclassified

“…A ocorrência destes spots é comumente observada nos trabalhos proteômicos (MIJNSBRUGGE et al, 2000;GION et al, 2005). …”

Section: Identificação De Proteínas Do Câmbio E Classificação Funcionalunclassified

“…A PEP atua como regulador negativo sobre a fosfofrutoquinase- . Trabalhos têm identificado transcritos e proteínas relacionados à fermentação alcoólica em espécies arbóreas, incluindo E. grandis (GION et al, 2005, JUAN et al, 2006, CELEDON et al, 2007 …”

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Avaliação do metabolismo primário da região cambial e casca de Eucalyptus grandis

Budzinski¹

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Ao CNPq e FAPESP (Processo n° 2009/00808-2), pela concessão das bolsas; À empresa Suzano Papel e Celulose pela disponibilização do material biológico e ao José Mateus Wisniewski por toda a ajuda durante as coletas;Aos docentes do Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas, da ESALQ; Ao Prof. Dr. Thomas Moritz, por ter me recebido em seu laboratório e permitido a realização da análise dos metabólitos, sendo sempre simpático e solícito;Aos técnicos do Umea Plant Science Centre: Inga-Britt e Krister, pela excelente convivência, ajuda com o preparo das amostras e análise dos dados. E a Pernilla pela ajuda inicial com os programas de análise.Aos amigos que fiz em Umea: Kate, Lili, Liudmila, Christian, Mateusz, Dereje e as brasileiras Ilka e Camila. Ter conhecido e estado com vocês foi muito gostoso; Ao Querido Dr. David Moon, por toooooooda a ajuda, conversas, sugestões e cafés e principalmente por me incentivar! À Lívia Franceschini, pela agradável convivência, papos e principalmente por toda a ajuda/ suporte com a bioinformática.Ao Dr. e Engenheiro Agrônomo Luis Felipe Boaretto, o meu amigo Felipão, com quem aprendi muito. Você sabe que sou sentimental então, obrigada por sua amizade, sinceridade, companheirismo, respeito, desabafos, apoio, nossas conversas farão falta -Sucesso SEMPRE meu caro; Ao meu amigo e Dr. Faldinha (Thiago Falda Leite). Obrigada pela amizade, idéias, companheirismo, caronas, desabafos, horas de estudo ... saudade das nossas conversas.À Dani (Danielle Izilda Rodrigues da Silva), minha querida amiga de dentro e fora do lab. Por nossas risadas, bate-papos, desabafos, fofoquinhas (rs). Por ter me dado força quando mais precisei, levarei esses momentos para sempre; À futura Engenheira Agrônoma Julinha (Júlia Silva Morosini), minha parceira de trabalho, pelas conversas sérias e "não-sérias", amizade, preocupação, respeito, por sua competência e dedicação, foi muito bom "trabalhar" com você; À querida Hanazinha (Hana Silva) que é uma pessoa muito especial. Por nossas conversas, momento sérios, risadas e devaneios!! Aos coleguinhas Ivanzão (Ivan Mozol) e Camilinha (Camila Ribeiro) pela excelente convivência, caronas, conversas. Sucesso meninos! 6 Ao Felipinho (Felipe Garbelini Marques) por nossas conversinhas, coleguismo, caronas para as quantificações de mRNA e por sua fundamental ajuda durante o experimento de ritmo; Ao Matheus Bonato e Fernanda Salvato, pelas trocas de idéias e experiências que continuam, sempre que possível, apesar da correria.Ao amigo Léo (Ganso -Leonardo Ferreira), por me mostrar que eu preciso reler sobre o uso da vírgula (rs). Por sua super ajuda e contribuições e por nossa excelente convivência, valew Léo! À Carolzinha (Maria Carolina Quecini) por sua preocupação, sempre disposta a ajudar com os assuntos científicos e paralelos! Ao meu mais novo coleguinha Fabrício Edgar de Moraes, por nossa excelente convivência, papos, idéias, troca de experiências e por toda a sua compreensão com a minha "ausência laboratorial" em função da tese (rs)! Aos antigos e a...

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Section: Respiração Vegetalunclassified

“…A ocorrência destes spots é comumente observada nos trabalhos proteômicos (MIJNSBRUGGE et al, 2000;GION et al, 2005). …”

Section: Identificação De Proteínas Do Câmbio E Classificação Funcionalunclassified

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Avaliação do metabolismo primário da região cambial e casca de Eucalyptus grandis

Budzinski¹

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“…A sequência de cada tag é apresentada, seguida pelo seu número de cópias nas bibliotecas de folhas (F) e de madeira (M), identificação e valor E. A diferença estatística significativa entre o número de cópias de uma tag nas bibliotecas, quando presente, é representada por (**) para P ≤ 0,01, e (*) para P ≤ 0,05 (Teste Z). Em trabalhos recentes, transcritos e proteínas para enzimas relacionadas à respiração anaeróbia têm sido identificadas durante a formação do xilema e crescimento secundário (GION et al, 2005, JUAN et al, 2006 et al, 2006). Por outro lado, o açúcar rafinose representa um importante produto da fotossíntese em algumas plantas funcionando tanto no transporte através do floema quanto como composto de reserva de energia (SPRENGER & KELLER, 2000, NORWOOD et al, 2000, KOCHHAR et al, 2003.…”

Section: Perfil Comparativo Da Expressão Gênica Entre Folhas E Madeiraunclassified

Caracterização de perfis transcricionais de folhas e da região cambial de Eucalyptus grandis usando o SAGE

Carvalho¹

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RESUMO Caracterização de perfis transcricionais de folhas e da região cambial de Eucalyptus grandis usando o SAGEApenas muito recentemente estratégias genômicas e pós-genômicas têm sido utilizadas em estudos de espécies arbóreas importantes na silvicultura. Nos países tropicais, a exemplo do Brasil, as espécies de eucalipto são especialmente importantes nos plantios comerciais principalmente destinados à indústria de papel e celulose. O eucalipto é caracterizado por elevadas taxas de crescimento e alta adaptabilidade resultante da interação de mecanismos moleculares e processos metabólicos ainda pouco conhecidos. Nesse sentido, o presente trabalho teve como objetivo principal o estabelecimento de perfis transcricionais comparativos para folhas e para o xilema em formação de árvores de Eucalyptus grandis. O uso do método SAGE permitiu analisar 5864 genes dos quais 2247 (38%) puderam ser identificados. Foram encontrados 464 genes diferencialmente expressos, sendo 47 exclusivamente expressos na região cambial e 64 nas folhas. Além disso, as estratégias adotadas na identificação tags-genes permitiram que as SAGE tags fossem eficientemente utilizadas na diferenciação de isoformas gênicas tecido-específicas e de localização celular específica. Genes relacionados à fotossíntese, fotorrespiração e destoxificação celular foram preferencialmente encontrados na biblioteca SAGE de folhas, enquanto genes relacionados à síntese da parede celular, organização do citoesqueleto e respiração, foram preferencialmente expressos na biblioteca SAGE de madeira. Os níveis de expressão dos transcritos sugeriram a ocorrência de possíveis mecanismos de controle transcricional comum para grupos de genes funcionalmente relacionados e foram também utilizados para sugestão de genes e processos que representam alvos potenciais para o melhoramento do eucalipto.Palavras-chave: Eucalyptus, SAGE, folhas, xilema, fotossíntese, fotorrespiração, respiração, parede celular 9 ABSTRACT Caracterization of Eucalyptus grandis leaves and cambial region transcriptomes using SAGERecently genomic and post-genomic strategies have been used to study important tree species in planted forests. In the tropical countries, like Brazil, Eucalyptus species are especially important in commercial plantations destined for the paper and cellulose industry. Eucalyptus species are characterized by their high growth rates and great adaptability resulting from the interaction between molecular mechanisms and metabolic processes that are still uncharacterized. Thus, the main goal of this work was the comparison of the transcriptional profiles from leaves and the cambial region of Eucalyptus grandis trees. The use of SAGE allowed the evaluation of 5864 expressed tags of which 2247 (38%) could be identified. 464 differentially expressed tags were indicated, of which 47 were exclusively expressed in the cambial region library and 64 in the leaf library. Furthermore, the strategies used in the tag mapping process allowed an efficient use of the SAGE tags to distinguish gene isoform...

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“…No caso de espécies arbóreas, diversos estudos vêm sendo conduzidos em Pinus GION et al 2005), Populus e Eucalyptus (PLOMION et al, 2003;CELEDON et al, 2007).…”

Section: Proteômicaunclassified

Análise serial da expressão gênica do caule de plantas de Eucalyptus grandis com 6 meses de idade

Carneiro¹

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The proteome of maritime pine wood forming tissue

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Avaliação do metabolismo primário da região cambial e casca de Eucalyptus grandis

Avaliação do metabolismo primário da região cambial e casca de Eucalyptus grandis

Caracterização de perfis transcricionais de folhas e da região cambial de Eucalyptus grandis usando o SAGE

Análise serial da expressão gênica do caule de plantas de Eucalyptus grandis com 6 meses de idade

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