The nature of inbreeding in a seed orchard of Douglas fir as shown by an efficient multilocus model

Abstract

The amounts of self-fertilization versus consanguineous matings (as measured by effective selfing) was estimated in a seed orchard of Douglas-fir, using progeny array data at six allozyme loci. The orchard is family structured, consisting several grafts (clones) and/or open-pollinated (o-p) progeny from each of several 'plus-trees'. Population-wide selfing rates were found to be 7% for the o-p trees and 2% for the cloned trees. Estimates of mating system parameters for individual trees showed this difference for average outcrossing rate t (1) still largely remained when outcrossingpollen gene frequency p was not allowed to vary among trees and (2) disappeared when p was allowed to vary among trees. Under this joint t and p estimation, o-p trees showed both significant variation of t (based upon a one-way ANOVA grouped by common plus-tree) and significant regressions of p on ovule genotype (indicative of consanguineous matings); cloned trees showed neither. This higher rate of consanguineous mating for o-p trees might be explained by the larger and more variable size of o-p families in the orchard. Estimates of outcrossing rate t and outcrossingpollen gene frequency p were based upon a multilocus model which makes full use of the information in the data. The increased information it gives over 'observed outcross' models is equivalent to adding 30-50% more loci, and it gives enough degrees of freedom to jointly estimate t and p for individual trees (individual progeny arrays) under certain conditions. In addition, inclusion of megagametophyte data nearly doubles the information about the mating system of individual trees.

Sistema de reprodução em Caesalpinia echinata Lam. implantada em arboreto experimental

“…Taxa de cruzamento entre parentes -A diferença entre a taxa de cruzamento multiloco e a uniloco pode ser usada para inferir sobre a taxa de cruzamento entre indivíduos parentes, visto que a taxa de cruzamento uniloco é esperada ser menor do que a multiloco, diante de progênies advindas de endogamia biparental. Esperase que a taxa de cruzamento uniloco seja viciada para baixo diante de qualquer endogamia adicional à autofecundação, gerando diferença positiva em relação à taxa de cruzamento multiloco, que por sua natureza multiloco é menos susceptível a violações das pressuposições do modelo (Ritland & Jain 1981, Ritland & El-Kassaby 1985. A diferença entre as taxas de cruzamentos multiloco e uniloco indicou a presença de 7,8% de cruzamento entre parentes.…”

Taxas de cruzamento em uma população natural de Cryptocarya Moschata Nees (Lauraceae)

“…O χ 2 de aderência ao modelo foi significativo para 11 dos 16 locos polimórficos analizados em C. moschata. Um dos fatores preponderantes para a ocorrência de χ 2 significativos, para o teste de adequação ao modelo de cruzamento misto, são os cruzamentos preferenciais (Ritland & El-Kassaby 1985). Os locos significativos foram eliminados e o programa foi rodado novamente, sendo que nem a taxa de cruzamento, nem os demais parâmetros foram notavelmente alterados.…”

“…Contudo, as simulações feitas por Ritland & Jain (1981) mostraram a permanência de estimativas viesadas de autofecundação quando poucos locos foram utilizados, sugerindo que um método mais direto torna-se necessário para se estimar a proporção de endogamia causada por cruzamentos endogâmicos. Um método dessa natureza seriam as estimativas multilocos conjuntas de t e p para as árvores individuais (Ritland & El-Kassaby 1985), apresentado na tabela 2.…”

Mating system in rye: variability in relation to the population and plant density

“…This model states that a certain proportion of zygotes arises from self-fertilization and the remainder is a product of random mating with other plants of the population (Ritland, 1983).…”