The human olfactory receptor 17-40: Requisites for fitting into the binding pocket

A computational microscope focused on the sense of smell

“…Once the latter is chosen, the main difficulty stands in an accurate sequence alignment between the target OR and the template [88]. In most studies, OR were built based on either the rhodopsin or the b2-adrenergic folds [63,72,74,75,80,87,101,122,123]. Opsin was recently proposed as a good structural model for OR [121].…”

“…A comparison between analogs of helional was performed on hOR3D1 using the thermodynamic integration method. It also allowed splitting odorants between binders and non-binders by comparing their computed affinities with the receptor [74]. In the special case of rat OR-I7 bound to aldehydes, a hybrid Quantum Mechanics/ Fig.…”

Study of Structure Activity Relationship to Determine of Aroma Compound Characteristic through Molecular Docking Testing

“…Hal tersebut dapat dipengaruhi oleh gaya hidup, interaksi sosial, penamaan dan memori aroma yang berhubungan dengan makanan [2]. Pendekatan secara objektif telah diteliti sejak tahun 1930 melalui prediksi hubungan struktur molekul dengan aroma yang dihasilkan dan hingga saat ini teori tersebut telah sebagian berhasil dalam mengelompokkan beberapa senyawa terhadap suatu aroma tertentu dan memprediksi aroma berdasarkan struktur molekulnya [3].…”

Study of Structure Activity Relationship to Determine of Aroma Compound Characteristic through Molecular Docking Testing

“…Persepsi aroma yang pengujiannya melalui profil organoleptik merupakan fenomena individual dan bersifat subjektif terhadap memori otobiografi. Hal tersebut dapat dipengaruhi oleh gaya hidup, interaksi sosial, penamaan dan memori aroma yang berhubungan dengan makanan [2]. Pendekatan secara objektif telah diteliti sejak tahun 1930 melalui prediksi hubungan struktur molekul dengan aroma yang dihasilkan dan hingga saat ini teori tersebut telah sebagian berhasil dalam mengelompokkan beberapa senyawa terhadap suatu aroma tertentu dan memprediksi aroma berdasarkan struktur molekulnya [3].…”