Para avaliar a germinação e sanidade de sementes em função da aplicação foliar de produtos alternativos isolados e associados a fungicida na cultura da soja, foram utilizadas amostras de sementes coletadas em 2016/2017 e 2017/2018, das cultivares NA5909 e TMG7062, semeadas em outubro e dezembro. Os tratamentos foram constituídos da aplicação foliar de produtos à campo, com Bacillus subtilis, quitosana, enxofre e hipoclorito de sódio, isolados ou associados ao fungicida e o fungicida isolado aplicado duas e três vezes. A germinação da NA5909 não apresentou diferença estatística entre os tratamentos, nas duas épocas de semeadura, nas duas safras. Na TMG7062, os tratamentos com B. subtilis, quitosana, e enxofre, isolados e associados ao fungicida, e o fungicida isolado diferiram da testemunha apenas na primeira época de semeadura. NA5909 apresentou maiores valores de germinação que TMG7062. Os produtos alternativos testados não apresentaram efeitos fitotóxicos à germinação das cultivares. Na segunda época de semeadura houve menor incidência de patógenos nas sementes e maior germinação nas duas cultivares. O fungicida isolado, B. subitilis e enxofre isolados e associados ao fungicida reduziram a incidência dos patógenos nas das cultivares. Não houve diferença para a germinação e sanidade com duas ou três aplicações do fungicida.