The draft genome of Staphylococcus warneri TRPF4, a bacteriocin producer with potent activity against the causative agent of Legionnaires' Disease

Freitas, Fernanda; Vidigal, Pedro Marcus Pereira; Siqueira, Tatiane de Paula; Barros, Mariana de; Tótola, Marcos Rogério

doi:10.1007/s13205-020-02231-3

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“…The DNA and protein sequences generated so far for organisms from the island may be considered scarce when taking into account the diversity of species studied. Most of the entries recovered in our search are from studies of the biology of microorganisms (Rodrigues et al, 2015;Silva et al, 2015), genomics of microorganisms (Rodrigues et al, 2016;Rodrigues et al, 2017;Souza-Freitas et al, 2020), and taxonomic studies of plants (Gama et al, 2016;Dantas et al, 2017) and fishes (Pinheiro et al, 2016). Notably, no sequence obtained directly from fungal specimens was retrieved.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Perdida em Meio à Vastidão do Oceano Atlântico: Síntese da Tendência de Publicações, Diversidade Biológica e Conservação na Ilha da Trindade

et al. 2023

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Trindade é uma ilha oceânica de origem vulcânica no Atlântico Sul. Embora tenhasofrido muitos impactos ambientais, a ilha abriga uma rica diversidade biológica, sendo habitatde várias espécies endêmicas. As pesquisas científicas nos últimos 300 anos geraram um grandevolume de literatura especializada. No entanto, não existe uma síntese científica sumarizando osprincipais achados das pesquisas no último século na ilha, o que dificulta o entendimento das lacunasdo conhecimento, bem como o reconhecimento da biodiversidade na ilha e como promover suaconservação. Essa revisão tem por objetivo apresentar uma síntese da pesquisa científica realizada naIlha da Trindade, com ênfase na área de ciências biológicas. Para tanto, foi realizada uma busca onlinecom palavras-chave no CrossRef, Google Scholar e NCBI, e pesquisa sobre a ameaça de extinçãoglobal na lista vermelha da União Internacional para a Conservação da Natureza. Foram recuperadas312 referências, principalmente de pesquisas da área de Ciências Biológicas, da Saúde e Agrárias. Maisde 1000 espécies divididas em cinco reinos têm ocorrência relatada na ilha, a maioria em ambientesoceânicos. Trinta e duas espécies que ocorrem em Trindade estão ameaçadas de extinção. Animais eplantas são os organismos mais estudados, enquanto a diversidade de microrganismos é a principallacuna de conhecimento no reconhecimento da biota da ilha. Dados sobre a diversidade biológica da ilha, conservação e tendências de publicação são apresentados e discutidos. Uma lista de todasas espécies relatadas na literatura recuperada e seu estado de conservação também é apresentada.

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Section: Discussionmentioning

confidence: 99%

Perdida em Meio à Vastidão do Oceano Atlântico: Síntese da Tendência de Publicações, Diversidade Biológica e Conservação na Ilha da Trindade

et al. 2023

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“…Anteriormente, Consuelo et al (2022) isolaram S. warneri (TP8) do intestino da larva de Acrobasis nuxvorella, com capacidade de produzir tanase, enzima responsável por hidrolisar ligações éster de taninos. S. warneri também já foi isolada de ambientes diversos como da pele de peixes (Musharrafieh et al, 2014), de águas marinhas da Ilha da Trindade, Brasil (Freitas et al, 2020), da pele de humanos (Karam e Ribeiro, 2022), do intestino de humanos e camundongos (Louail et al, 2023).…”

Section: Atribuição De Taxonomiaunclassified

“…Como S. warneri possui potencial de produção de bacteriocinas, fez-se necessário a construção de curvas de crescimento em cultura pura e em consórcio microbiano, a fim de verificar a ocorrência de inibição do crescimento quando em co- (Freitas et al, 2020;Verdon et al, 2008). Xanthomonas sp.…”

Section: S Warneri E S Liquefaciens Crescem Em Consórciounclassified

Aplicação de microrganismos lipolíticos em alimentos e na biodegradação de poliuretanos

Salgado

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Os microrganismos são considerados fontes inestimáveis de compostos extracelulares, como enzimas, tornando-os o centro da investigação científica, tanto nos aspectos de biodeterioração em que estão envolvidos, quanto para aplicação biotecnológica. As lipases são enzimas responsáveis principalmente, pela hidrólise dos triacilgliceróis e amplamente exploradas comercialmente. Além da hidrólise, conseguem catalisar a reação reversa, a esterificação e, também reações como transesterificação, interesterificação, acidólise e aminólise. Dese modo, as lipases são reconhecidas como catalisadores promissores no melhoramento da qualidade sensorial de diversos produtos alimentícios além de, biodegradarem diversos substratos. A lipase de Serratia liquefaciens L135 foi identificada como uma poliuretanase, ou seja, uma enzima com a capacidade de biodegradar poliuretanos (PU). Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de explorar o potencial desta enzima na indústria de alimentos e na biodegradação de poliuretanos por S. liquefaciens isoladamente ou em consórcio microbiano. Para isso buscou-se isolar potenciais biodegradadores de PU do intestino de larvas de Galleria mellonella e avaliar o efeito da associação com S. liquefaciens na biodegradação de PU in vitro. O primeiro capítulo apresenta uma revisão de literatura que abrange as aplicações de lipases em indústrias de laticínios; óleos e gorduras; panificação e confeitaria; carnes; sabores e aromas; e outras indústrias alimentícias. Além disso, aborda as técnicas de fermentação de baixo custo e engenharia de proteínas, como promissoras para produção de lipases microbianas. No segundo capítulo são apresentados resultados de estudos in silico e in vitro do potencial biodegradador de PU por S. liquefaciens L135 e sua poliuretanase. Para o estudo in silico, foram construídos monômeros e tetrâmeros de PU para realizar o docking molecular com a poliuretanase modelada e validada de S. liquefaciens. Foi possível verificar que os PU ligaram ao resíduo de aminoácido S207, que faz parte da tríade catalítica e é responsável pela ação hidrolítica da poliuretanase. Os monômeros apresentaram melhores scores de ligações, quando comparados com os tetrâmeros, devido às interações estéricas repulsivas. Os PU, Impranil® e poli[4,4'-metilenobis(fenilisocianato)-alt-1,4- butanodiol/di(propilenoglicol)/policaprolactona] (PCLMDI), foram usados para as análises in vitro. A biodegradação do Impranil® por S. liquefaciens e sua poliuretanase foi confirmada em ágar pela formação de halos transparentes. Além disso, foram preparados discos de Impranil® e filmes de PCLMDI e a biodegradação durante o cultivo de S. liquefaciens foi avaliada por microscopia eletrônica de varredura (MEV). Foi possível averiguar a formação de rachaduras e poros na superfície dos PU, configurando o processo de biodegradação. No terceiro capítulo, foi feito o isolamento da bactéria Staphylococcus warneri do intestino da larva de G. mellonella, com potencial de biodegradação de PU. O isolado S. warneri, denominado de UFV_01.21, foi avaliado em cultura pura e em consórcio com S. liquefaciens L135 para biodegradação de PU e, em ambas condições, o Impranil® foi utilizado como única fonte de carbono. Com seis dias de incubação, suspensões de Impranil® em caldo Luria-Bertani (LB) inoculadas com S. liquefaciens, S. warneri e com consórcio microbiano, apresentaram 88, 96 e 76% de biodegradação, respectivamente. Tanto nos discos de Impranil®, quanto em filmes de PCLMDI, S. warneri em cultura pura e em consórcio com S. liquefaciens foi capaz de aderir e formar biofilmes. Por MEV, foi possível confirmar a biodegradação devido a formação de rachaduras, sulcos, poros e rugosidades nas superfícies dos PU avaliados. Esses resultados reforçam o potencial dos microrganismos e suas enzimas para biodegradação de PU. Palavras-chave: Biocatalisadores. Biodegradação. Consórcio Microbiano. Docking Molecular.

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Biodegradation of polyurethanes by Staphylococcus warneri and by microbial co-culture

Salgado,

Pereira Vidigal,

Dantas Vanetti

2024

Chemosphere

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The draft genome of Staphylococcus warneri TRPF4, a bacteriocin producer with potent activity against the causative agent of Legionnaires' Disease

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Perdida em Meio à Vastidão do Oceano Atlântico: Síntese da Tendência de Publicações, Diversidade Biológica e Conservação na Ilha da Trindade

Perdida em Meio à Vastidão do Oceano Atlântico: Síntese da Tendência de Publicações, Diversidade Biológica e Conservação na Ilha da Trindade

Aplicação de microrganismos lipolíticos em alimentos e na biodegradação de poliuretanos

Biodegradation of polyurethanes by Staphylococcus warneri and by microbial co-culture

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