The Agrobacterium Tumefaciens C58 Genome

Slater, Steven; Goodner, Brad; Setúbal, João Carlos; Goldman, Barry S.; Wood, Derek W.; Nester, Eugene W.

doi:10.1007/978-0-387-72290-0_4

Cited by 5 publications

(1 citation statement)

References 128 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Различия отмечены в подсистемах: аминокислоты и производные -452 функции у L1 и 389 -у М3; по продукции кофакторов, витаминов, пигментов -195, 159; жирных кислот, липидов, изопреноидов -115, 97; ароматических веществ -63, 44; вторичных метаболитов -13, 7 соответственно.У штамма A. tumefaciens R1 в общей сложности 5350 CDS идентифицированы в RAST, при этом 29% из них классифицированы в 361 подсистему. Среди полученных последовательностей не обнаружено генов вирулентности, отвечающих за проникновение ДНК в клетки растений, что определяется наличием Ri-и Ti-плазмид[45]. Не выявлено также генов нодуляции и фиксации азота (является особенностью семейства Rhizobiaceae, к которому относится этот вид), а также ростстимуляции (отмечена некоторыми исследователями[46]).…”

unclassified

Ассоциативные Микроорганизмы Растений: Выделение Штаммов И Их Изучение

Якубовская¹,

Kameneva²,

Didovich³

et al. 2021

View full text Add to dashboard Cite

В монографии раскрыты методологические подходы к выделению и изучению ассоциативных с определенным видом растений штаммов микроорганизмов, обобщены результаты исследований по идентификации и эффективности штаммов, выделенных с апикальной части корней томата (Solanum lycopersicum L.), капусты (Brassica oleracea var. capitata L.), огурца (Cucumis sativus L.), пшеницы (Triticum aestivum L.), риса (Oryza sativa L.) и других культур (Sorghum bicolor L., Salvia sclarea L. и Coriandrum sativum L.), а также цианобактериальных консорциумов на основе симбиотических и ассоциативных микроорганизмов для целей агробиотехнологии. Монография предназначена для микробиологов, биотехнологов, экологов, физиологов, аспирантов и студентов высших учебных учреждений. В монографии приведены результаты исследований, выполненные в рамках, государственных заданий фундаментальных исследований № 0834-2015-0005, № 0834-2015-0001, № 0834-2019-0005, № 0834-2019-0001 и при поддержке грантов РФФИ: № 18-016-00197, 14-44-01621, 5-29-01272, 18-016-00184, 16-34-50060.

show abstract

unclassified

Ассоциативные Микроорганизмы Растений: Выделение Штаммов И Их Изучение

Якубовская¹,

Kameneva²,

Didovich³

et al. 2021

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Plasmids of the Rhizobiaceae and Their Role in Interbacterial and Transkingdom Interactions

Pappas

Cevallos

2010

Soil Biology

View full text Add to dashboard Cite

Effective removal of a range of Ti/Ri plasmids using a pBBR1-type vector having a repABC operon and a lux reporter system

Yamamoto

Sakai

Agustina

et al. 2018

Appl Microbiol Biotechnol

View full text Add to dashboard Cite

Ti and Ri plasmids of pathogenic Agrobacterium strains are stably maintained by the function of a repABC operon and have been classified into four incompatibility groups, namely, incRh1, incRh2, incRh3, and incRh4. Removal of these plasmids from their bacterial cells is an important step in determining strain-specific virulence characteristics and to construct strains useful for transformation. Here, we developed two powerful tools to improve this process. We first established a reporter system to detect the presence and absence of Ti/Ri plasmids in cells by using an acetosyringone (AS)-inducible promoter of the Ti2 small RNA and luxAB from Vibrio harveyi. This system distinguished a Ti/Ri plasmid-free cell colony among plasmid-harboring cell colonies by causing the latter colonies to emit light in response to AS. We then constructed new "Ti/Ri eviction plasmids," each of which carries a repABC from one of four Ti/Ri plasmids that belonged to incRh1, incRh2, incRh3, and incRh4 groups in the suicidal plasmid pK18mobsacB and in a broad-host-range pBBR1 vector. Introduction of the new eviction plasmids into Agrobacterium cells harboring the corresponding Ti/Ri plasmids led to Ti/Ri plasmid-free cells in every incRh group. The Ti/Ri eviction was more effective by plasmids with the pBBR1 backbone than by those with the pK18mobsacB backbone. Furthermore, the highly stable cryptic plasmid pAtC58 in A. tumefaciens C58 was effectively evicted by the introduction of a pBBR1 vector containing the repABC of pAtC58. These results indicate that the set of pBBR1-repABC plasmids is a powerful tool for the removal of stable rhizobial plasmids.

show abstract

The Agrobacterium Tumefaciens C58 Genome

Cited by 5 publications

References 128 publications

Ассоциативные Микроорганизмы Растений: Выделение Штаммов И Их Изучение

Ассоциативные Микроорганизмы Растений: Выделение Штаммов И Их Изучение

Plasmids of the Rhizobiaceae and Their Role in Interbacterial and Transkingdom Interactions

Effective removal of a range of Ti/Ri plasmids using a pBBR1-type vector having a repABC operon and a lux reporter system

Contact Info

Product

Resources

About