Systematic Investigation of the Aspartimide Problem

Morpholine, a strong contender for Fmoc removal in solid‐phase peptide synthesis

“…One of the well-known side reactions in Fmoc-based SPPS is the formation of aspartimide (a five-membered ring structure) and byproducts derived thereof. 17,46 Although this reaction can take place during acidolytic global deprotection, it occurs mainly during the removal of Fmoc groups by base (usually PIP) in each cycle of amino acid incorporation. The effect of this side reaction during peptide elongation is accumulative, so the greater the number of synthetic cycles, the more side reactions.…”

Διερεύνηση της συμβολής περιοχών της υπομονάδας β3 του υποδοχέα α11bβ3 στη διαδικασία συσσώρευσης των ανθρωπίνων αιμοπεταλίων

“…Το ποσοστό αυτό µικραίνει όταν η ιστιδίνη εισαχθεί στις υδροξυλοµάδες της Wang ρητίνης ως Trt-His(Trt)-OH,56 σε πεπτίδια µε C-τελική Cys και His η χρήση της 2-χλωροτρίτυλο-ρητίνης αποτελεί την καλύτερη επιλογή για την παραλαβή οπτικώς καθαρών προϊόντων,144 η αποφυγή του σταδίου προενεργοποίησης, όταν η σύζευξη γίνεται παρουσία φωσφονικών ή ουρονικών παραγώγων, συµβάλει θετικά στη διατήρηση της οπτικής οµοιογένειας του αµινοξέος που πρόκειται να ακυλιωθεί,81,113 τα ευαίσθητα στη ρακεµοποίηση Ν α -προστατευµένα αµινοξέα θα πρέπει να εισέρχονται στην πεπτιδική αλυσίδα προστατευµένα µε κατάλληλες οµάδες, τέτοιες ώστε να µην ευνοείται η παραπάνω παράπλευρη αντίδραση. Στην περίπτωση της κυστεΐνης η χρήση της ξανθενυλοµάδας (Xan)185 για την προστασία της θειολοµάδας δίνει τα καλύτερα αποτελέσµατα, κατά την πρόσδεση του πρώτου αµινοξέος στην Wang ρητίνη η καταλυτική ποσότητα της διµεθυλοαµινοπυριδίνης στο διάλυµα της σύζευξης δεν πρέπει να υπερβαίνει τα 0,1eq (ως προς τα mmol των υδροξυλοµάδων της ρητίνης) και η αντίδραση εστεροποίησης να µην ξεπερνά την µια ώρα,136 η προσθήκη στο διάλυµα της σύζευξης των βοηθητικών πυρηνόφιλων HOBt, HOAt πολλές φορές (όχι πάντα) κρίνεται θετική, καθότι ως ασθενή οξέα εµποδίζουν την απόσπαση του Η α πρωτονίου από το ασύµµετρο άτοµο άνθρακα και περιορίζουν την έκταση της ρακεµοποίησης,55,81,113,184 όταν η κυστεΐνη εισέρχεται στη πεπτιδική αλυσίδα ως Fmoc-Cys(Trt)-OH η σύζευξη µε τη µέθοδο των καρβοδιϊµιδίων οδηγεί σε χαµηλά ποσοστά ρακεµοποίησης.55 (στ) DIC/HOBt ή HOAt µε προενεργοποίηση για 5 min σε µίγµα DMF/DCM (1/1) και (ζ) χρησιµοποιώντας τον ενεργό πενταχλωροφαινυλεστέρα (ΟPfp) του Ν απροστατευµένου αµινοξέος σε µίγµα διαλυτών DMF/DCM (1/1).3.13.3 ΣΧΗΜΑΤΙΣΜΟΣ ΑΣΠΑΡΤΙΜΙ∆ΙΟΥΟ σχηµατισµός ασπαρτιµιδίου (Asi από το Αspartimide)187 είναι µια παράπλευρη αντίδραση που λαµβάνει χώρα κατά τη διάρκεια της πεπτιδικής σύνθεσης όταν µια πολυπεπτιδική αλυσίδα περιέχει κατάλοιπα ασπαρτικού οξέος.Παρατηρείται κατά τη σύνθεση των πεπτιδίων τόσο µε την Boc/Bzl στρατηγική, από τις ισχυρά όξινες συνθήκες (HF ή TFMSA/TFA) που χρησιµοποιούνται για την αποµάκρυνση του πεπτιδίου από το στερεό πολυµερές,188 όσο και µε την Fmoc/tBu στρατηγική, από τις επαναλαµβανόµενες κατεργασίες της πεπτιδορητίνης µε το διάλυµα πιπεριδίνης47,183,[189][190][191][192][193][194][195][196] (συνθήκες αποκοπής Fmoc οµάδας). Σύµφωνα µε το µηχανισµό της αντίδρασης αυτής ο καρβονυλικός άνθρακας της παράπλευρης αλυσίδας του ασπαρτικού οξέος δέχεται πυρηνόφιλη προσβολή από το ζεύγος ηλεκτρονίων του αζώτου του πεπτιδικού σκελετού µε αποτέλεσµα το κλείσιµο του δακτυλίου και το σχηµατισµό του ιµιδικού δακτυλίου (σχήµα 3.49).…”