ΚΕΦΑΛΑΙΟ 2 ο ΔΟΜΗ DNA 3 2.1. Δομικά Συστατικά του DNA. 3 2.2. Δομή και Διαμόρφωση Νουκλεϊνικών Οξέων 6 ΚΕΦΑΛΑΙΟ 3 ο ΜΕΤΑΛΛΙΚΑ ΣΥΜΠΛΟΚΑ ΣΤΗΝ ΙΑΤΡΙΚΗ ΧΗΜΕΙΑ. ΜΕΛΕΤΗ ΤΗΣ ΑΛΛΗΛΕΠΙΔΡΑΣΗΣ ΤΟΥΣ ΜΕ ΝΟΥΚΛΕΟΤΙΔΙΑ 9 3.1. Βιολογική σημασία των μεταλλικών ιόντων 9 3.2. Ιστορία Μεταλλικών Συμπλόκων στην Ιατρική 3.3. Σύμπλοκα λευκοχρύσου: Παρελθόν, Παρόν και Μέλλον 3.4. Μεταλλικές ενώσεις ρηνίου (Re) 3.4.1. Φωτοφυσικές ιδιότητες συμπλόκων του τύπου fac-Re(CO) 3 (diim.)L 0/+ 3.4.2. Φωτοφυσικές ιδιότητες συμπλόκων του Re και DNA ΚΕΦΑΛΑΙΟ 4 ο ΦΩΤΟΕΠΑΓΟΜΕΝΗ ΟΞΕΙΔΩΣΗ ΝΟΥΚΛΕΟΤΙΔΙΩΝ 31 4.1. Οξειδωτική καταστροφή των βάσεων του DNA -Εισαγωγή 4.2. Προτίμηση της γουανίνης ως «οξειδωτικό στόχο» έναντι των άλλων βάσεων 4.3. Οξειδωτικές αντιδράσεις του DNA στο κομμάτι της γουανίνης 4.4. Μεταφορά φορτίου δια μέσω του DNA και η μακρινής κλίμακας οξειδωτική καταστροφή του 4.4.1. Πειράματα ελέγχου για τη διαπίστωση του αν η πορεία οξείδωσης είναι ενδομοριακή ή διαμοριακή. 4.4.2. Πειράματα που μαρτυρούν τη δραστικότητα διπλόκλωνων αλυσίδων που περιέχουν γουανίνες. 4.4.3. Γιατί προτιμώνται οι 5΄-GG-3΄οξειδωτικές διασπάσεις (ab initio υπολογισμοί) 4.4.4. Επίδραση κενών και παγίδων στη μακρινής κλίμακας μετακίνηση του κατιόντος ρίζας στο DNA. 4.4.5. Πειράματα που ενισχύουν τη θεωρία περί μεταπήδησης της οπής. 4.4.6. Πειραματικά αποτελέσματα που απορρίπτουν τη συμπεριφορά του DNA ως μοριακού καλωδίου. 4.4.7. Θεωρητική εξέταση της μεταφοράς ηλεκτρονίου στο DNA. 4.4.8. Οι τελευταίες απόψεις για τη μεταφορά φορτίου στο DNA 49 4.5. Επίδραση των μεταλλικών ιόντων στα νουκλεϊκά οξέα ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ 4.6. Φασματοσκοπικές και κινητικές μέθοδοι παρακολούθησης της διαδικασίας φωτοεπαγόμενης μεταφοράς ηλεκτρονίου 4.7. Φασματοσκοπικά δεδομένα που υποδηλώνουν σύνδεση ενός συμπλόκου με intercalation 4.8. Μηχανιστική εξέταση της φωτοεπαγόμενης οξείδωσης του DNA ΚΕΦΑΛΑΙΟ 5 ο ΦΑΣΜΑΤΟΣΚΟΠΙΚΕΣ ΜΕΘΟΔΟΙ 5.1. Βασικές αρχές κυκλικού διχρωισμού (CD) 5.1.1. Μονομερή 5.1.2. Δινουκλεοτίδια 5.1.3. Πολυνουκλεοτίδια 5.1.4 C.D. της δεξιόστροφης έλικας του DNA 5.1.5 Φάσματα C.D. άλλων διαμορφώσεων της έλικας του DNA. Μεταπτώσεις Β C και Β Α και ο ρόλος των μεταλλοϊόντων. 5.2 Θερμική μετουσίωση (τήξη) του φυσικού DNA Πειραματικό Μέρος ΚΕΦΑΛΑΙΟ 6 ο ΥΛΙΚΑ ΚΑΙ ΠΕΙΡΑΜΑΤΙΚΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ 83 6.1. Αντιδραστήρια-Αρχικές ουσίες-Διαλύτες 6.2. Όργανα-Μικροσυσκευές 6.3. Μέθοδοι-Πειραματική διαδικασία 6.3.1. Φάσματα κυκλικού διχρωισμού. 6.3.2. Προσδιορισμός σημέιων μετουσίωσης (τήξεως, Τ m ) 6.3.3. Φάσματα NMR 6.3.4. HPLC 6.3.5. Ηλεκτροφόρηση ολιγονουκλεοτιδίων 6.4. Θεωρητικοί υπολογισμοί ΚΕΦΑΛΑΙΟ 7 ο ΥΠΟΚΑΤΑΣΤΑΤΕΣ 88 7.1. Εισαγωγή 7.2. Ο υποκαταστάτης 2-(2΄-πυριδυλ)κινοξαλίνη 7.2.1. Σύνθεση του υποκαταστάτη 2-(2΄-πυριδυλ)κινοξαλίνη, (pq) 7.2.2. Χαρακτηρισμός του υποκαταστάτη 2-(2΄-πυριδυλ)κινοξαλίνη, (pq) 7.3. Ο υποκαταστάτης διπυριδο[3,2-α:2΄,3΄-c]φαιναζίνη, (dppz) 7.3.1. Σύνθεση του υποκαταστάτη διπυριδο[3,2-α:2΄,3΄-c]φαιναζίνη, (dppz) 7.3.2. Χαρακτηρισμός του υποκαταστάτη διπυριδο[3,2-α:2΄,3΄-c]φαιναζίνη, (dppz) ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΑ ΚΕΦΑΛΑΙΟ 8 ο ΣΥΝΘΕΣΗ ΚΑΙ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΟΣ ΣΥΜΠΛΟΚΩΝ 8.1. Σύνθεση συμπλόκων ...