STUDI IN SILICO PENGHAMBATAN AKTIVASI TLR2 EKSTRAK ETANOL DAUN SEMANGGI (Marsilea crenata Presl.)

Abstract

Neuroinflamasi dapat menyebabkan Parkinson Disease (PD), dengan salah satu mekanismenya adalah aktivasi berlebih toll-like receptor 2 (TLR2) akibat abnormalitas dan agregasi α-synuclein. Pada penelitian sebelumnya, daun semanggi (Marsilea crenata Presl.) terbukti menghambat progresivitas neuroinflamasi melalui jalur estrogen-receptor (ER) dependent. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi efek antineuroinflamasi daun semanggi pada jalur penghambatan aktivasi TLR2 (3A7B) dengan studi in silico. Senyawa hasil metabolite profiling sekunder dari ekstrak etanol 96% daun semanggi dipreparasi dengan ChemDraw Ultra 12.0, kemudian dilihat sifat farmakokinetik dan farmakodinamiknya dengan webtool SwissADME. Optimasi geometri pada senyawa dilakukan menggunakan Avogadro 1.0.1 dan molecular docking senyawa terhadap reseptor 3A7B dilakukan menggunakan Autodock vina (PyRx 0.8). Tahap visualisasi interaksi dilakukan dengan Biovia Discover Studio 2021, sedangkan nilai toksisitas senyawa dianalisis menggunakan ProTox II online tool. Hasil penelitian menunjukkan terdapat empat senyawa yang memenuhi kriteria farmakokinetik, farmakodinamik, toksisitas, serta mempunyai kemiripan dengan native ligand N-acetyl-D-glucosamine. Oleh karena itu, ekstrak etanol 96% daun semanggi diprediksi memiliki potensi sebagai penghambat progresifitas PD dengan mekanisme antineuroinflamasi.

Studi In Silico Senyawa Flavonoid dalam Mengambat RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) sebagai Antivirus COVID-19

“…Penelitian ini menggunakan 5 senyawa flavonoid yang diambil dari PubChem dan remdesivir digunakan sebagai kontrol positif, pemilihan ini dikarenakan remdesivir bekerja dengan berikatan pada RdRp dan dapat menghambat sintesis RNA virus [23][24][25]. Senyawa tersebut kemudian dilakukan minimisasi energi menggunakan software Avogadro, dengan pengaturan medan gaya yang menggunakan MMFF94 [26,27].…”

“…Sedangkan untuk melakukan analisis toksisitas, format SMILES digunakan untuk memprediksi nilai LD50 berdasarkan globally haramonized system (GHS) dengan menggunakan online tool ProTox II (http://tox.charite.de/protox_II/) [31,32]. Penggunaan format SMILES dilakukan dengan menuliskan SMILES pada canonical smiles dan kemudian dijalankan dengan mengklik tombol start Tox-Prediction.…”