Resumo: Os fungos são ditos anemófilos quando dispersos por via atmosférica e são causadores de doenças alérgicas. O objetivo da presente pesquisa foi analisar a qualidade do ar de uma biblioteca pública universitária, no município de Fortaleza-CE, através de identificação da microbiota fúngica. Para tanto, analisou-se 4 setores, a saber: Recepção, Acervo Geral, Sala de Estudo Coletivo e Administração. Foram realizadas coletas mensais em cada setor, através do método da sedimentação passiva em placas de Petri, contendo o meio de cultura Ágar Batata Dextrose (Himedia®). Cada placa ficou exposta por 8 horas. Findo o período de coleta, as amostras vedadas seguiram para o laboratório, onde permaneceram incubadas a temperatura ambiente durante sete dias, realizando-se observações diárias. A partir do aparecimento de colônias fúngicas procedeu-se a contagem global e identificação das mesmas através de análise macro e micromorfológica. No total de 36 placas expostas, isoladas 187 colônias e identificados 4942 unidades formadoras de colônias com 25 gêneros fúngicos. A sequência dos locais mais contaminados foi: Recepção, Acervo, Sala de Estudo Coletivo e Administração. No geral, foram verificados importantes fungos desencadeadores de alergias respiratórias, como: Aspergillus sp., Penicillium sp., Alternaria sp. e Cladosporium sp. Um dos gêneros de maior expressão foi a Chrysonilia sp, patógeno vegetal que potencializa a degradação do acervo presente. Por fim, pondera-se que diferentes ambientes de uma biblioteca podem ser insalubres, pois possui grande quantidade de fungos anemófilos que podem desencadear alergias respiratórias nos frequentadores sendo assim necessários mais estudos do caso e monitoramento periódico do ar na biblioteca.