South from Alaska: A Pilot aDNA Study of Genetic History on the Alaska Peninsula and the Eastern Aleutians

Rohrs, U.H.; Linde, L.P.

doi:10.3378/027.082.0510

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“…Archeology has recently witnessed the downfall of the “Clovis-first” theory – envisioning an entry time, not prior to 13 thousand years ago (kya), which is in agreement with the dating of the Clovis culture in North America – and the staggering discovery of pre-Clovis sites in Monteverde (Chile) [5]–[6] and Texas [7], both dated as early as 15.5–14.5 kya [8]. Major genetic contributions have come from mitochondrial DNA (mtDNA) studies, mainly carried out in modern populations, but also with a non-negligible and steadily increasing input from ancient human remains [9]–[12]. Increasing data support the scenario that the ancestors of Paleo-Indians settled in Beringia before the Last Glacial Maximum (LGM), which may have later forced them into distinct enclaves when climatic conditions worsened.…”

Section: Introductionsupporting

confidence: 78%

Arrival of Paleo-Indians to the Southern Cone of South America: New Clues from Mitogenomes

et al. 2012

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With analyses of entire mitogenomes, studies of Native American mitochondrial DNA (mtDNA) variation have entered the final phase of phylogenetic refinement: the dissection of the founding haplogroups into clades that arose in America during and after human arrival and spread. Ages and geographic distributions of these clades could provide novel clues on the colonization processes of the different regions of the double continent. As for the Southern Cone of South America, this approach has recently allowed the identification of two local clades (D1g and D1j) whose age estimates agree with the dating of the earliest archaeological sites in South America, indicating that Paleo-Indians might have reached that region from Beringia in less than 2000 years. In this study, we sequenced 46 mitogenomes belonging to two additional clades, termed B2i2 (former B2l) and C1b13, which were recently identified on the basis of mtDNA control-region data and whose geographical distributions appear to be restricted to Chile and Argentina. We confirm that their mutational motifs most likely arose in the Southern Cone region. However, the age estimate for B2i2 and C1b13 (11–13,000 years) appears to be younger than those of other local clades. The difference could reflect the different evolutionary origins of the distinct South American-specific sub-haplogroups, with some being already present, at different times and locations, at the very front of the expansion wave in South America, and others originating later in situ, when the tribalization process had already begun. A delayed origin of a few thousand years in one of the locally derived populations, possibly in the central part of Chile, would have limited the geographical and ethnic diffusion of B2i2 and explain the present-day occurrence that appears to be mainly confined to the Tehuelche and Araucanian-speaking groups.

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Section: Introductionsupporting

confidence: 78%

Arrival of Paleo-Indians to the Southern Cone of South America: New Clues from Mitogenomes

et al. 2012

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“…Debido a la fragmentación del ADN en las muestras antiguas, se amplificaron por PCR tres fragmentos solapantes menores a 221 pares de bases (pb) de la Región Hipervariable I (RHV I), entre las posiciones 16023 y 16410, utilizando los iniciadores: HVR1_P1F y HVR1_P1Rc (Raff et al, 2010), M13-L16120, M13R-H16239 y M13-L16208 (Adachi et al, 2009), y R16410 (Gabriel et al, 2001) (Tabla 2). A fin de refinar la caracterización de los subhaplogrupos de C1, se secuenció un fragmento de 284 pb perteneciente a la Región Hipervariable II (RHV II), en busca del polimorfismo 493G, diagnóstico de C1b, utilizando los iniciadores F314 y R597 (Motti, 2012) (Tabla 2).…”

Section: Secuenciamiento De La Región Hipervariable I Del Adn Mitocondrialunclassified

Diversidad genética en restos humanos de contextos arqueológicos tardíos de la provincia de Santiago del Estero a partir del estudio de ADN mitocondrial

2019

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En este artículo se presentan los primeros resultados del secuenciamiento de la Región Hipervariable I del ADN mitocondrial de restos óseos humanos arqueológicos de la provincia de Santiago del Estero, con el objeto de contribuir al conocimiento sobre la diversidad genética de las poblaciones de la llanura santiagueña y los procesos de interacción con grupos de otras regiones de Argentina en tiempos prehispánicos tardíos. Se obtuvieron resultados positivos en 5 de las 10 muestras estudiadas que permitieron la identificación de 5 haplotipos diferentes. Una de las muestras, proveniente del norte del Río Dulce, presenta las mutaciones características del subhaplogrupo D1j, mientras que los demás individuos fueron asignados a linajes derivados de C1. La comparación de los haplotipos obtenidos en este trabajo con secuencias prehispánicas compiladas de la literatura no muestra una conexión con las poblaciones que habitaron el NOA en tiempos tardíos ni tampoco con los grupos chaco-litoraleños. En cambio, se observa claramente un vínculo biológico entre las poblaciones de la llanura santiagueña y los grupos de la región central de Argentina (fundamentalmente de la actual provincia de Córdoba) y de los valles del centro-oeste argentino. A pesar de su reducido número, los haplotipos obtenidos dan cuenta de este fenómeno: de las cinco secuencias obtenidas, tres fueron asignadas a los linajes D1j, C1d1b y C1b+146 que han sido señalados como indicadores de un estrecho vínculo entre las poblaciones del centro y el oeste argentino, y evidenciadel mantenimiento de flujo génico entre ellas.

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“…Debido a la fragmentación del ADN en las muestras antiguas, se amplificaron dos fragmentos solapantes menores a 221 pares de bases (pb) de la RHV-I del ADN mitocondrial, entre las posiciones 16101 y 16410, utilizando los iniciadores descriptos en Adachi et al (2009). Para el caso de las muestras más degradadas se amplificaron tres fragmentos menores a 160 pb, comprendidos entre los nucleótidos 16022 y 16422 (Raff et al, 2010). Los productos de PCR se enviaron a Macrogen (Seúl, Corea) para su purificación y posterior secuenciamiento de ambas cadenas de ADN.…”

Section: Secuenciamiento De La Región Hipervariable I Del Adn Mitocondrial (Rhv-i)unclassified

Diversidad Genética en Restos Humanos Arqueológicos Del Sitio El Diquecito (Costa Sur, Laguna Mar Chiquita, Provincia De Córdoba).

Nores

Fabra

García

et al. 2016

Rev Arg Antrop Biol

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En este trabajo presentamos resultados del análisis de haplogrupos y secuencias de la Región Hipervariable I del ADN mitocondrial (RHV-I) en restos humanos del sitio El Diquecito, en la región sur de la Laguna Mar Chiquita, provincia de Córdoba, con antigüedades comprendidas entre 2562 ± 47 y 537 ± 57 14C años AP. De los 14 individuos analizados, 13 pudieron ser tipificados por APLP. Siete fueron asignados al haplogrupo C, cuatro al haplogrupo D y el restante no pudo ser amplificado por PCR. Se obtuvieron secuencias de 10 individuos, y todos ellos pudieron ser asignados con certeza a un linaje mitocondrial de origen continental americano, que coincidió con el determinado previamente por APLP. Entre las 7 secuencias correspondientes al haplogrupo C1 se reconocen 2 haplotipos diferentes, aunque sólo una no presenta el haplotipo nodal. Entre las 4 secuencias pertenecientes al haplogrupo D1 se distinguen 3 haplotipos diferentes: uno corresponde al haplotipo nodal, otro al subhaplogrupo D1j y los dos restantes al subhaplogrupo D1g. Si bien las conclusiones que pueden realizarse a partir del estudio de un solo sitio son limitadas, el estudio de la diversidad de linajes mitocondriales de los pobladores antiguos de la costa sur de la Laguna Mar Chiquita representa un nuevo aporte para comprender los procesos microevolutivos que sufrieron las poblaciones originarias del centro de Argentina.

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South from Alaska: A Pilot aDNA Study of Genetic History on the Alaska Peninsula and the Eastern Aleutians

Cited by 21 publications

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Arrival of Paleo-Indians to the Southern Cone of South America: New Clues from Mitogenomes

Arrival of Paleo-Indians to the Southern Cone of South America: New Clues from Mitogenomes

Diversidad genética en restos humanos de contextos arqueológicos tardíos de la provincia de Santiago del Estero a partir del estudio de ADN mitocondrial

Diversidad Genética en Restos Humanos Arqueológicos Del Sitio El Diquecito (Costa Sur, Laguna Mar Chiquita, Provincia De Córdoba).

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