Some structural aspects of protein-nucleic acid recognition point mechanisms involving amino acid carboxylic groups

Zheltovsky, N. V.; Samoilenko, S. A.; Kolomiets, Iryna M.; Kondratyuk, I. V.; Губайдуллин, М. И.

doi:10.1016/0022-2860(89)80003-1

Cited by 17 publications

(9 citation statements)

References 12 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Прикладом зв'язування карбоксилат-іона з G є взаємодія Glu-46 в активному центрі рибонуклеази ТІ із специфічним інгібітором 2'GMP [66]. Депротонована карбоксильна група бічного радикалу Glu46 утворює комплекс з G, зв'язуючися з імінопротоном N1H та амінопротоном у повній відповід ності до даних [42][43][44][45][46].…”

Section: схема Ii)unclassified

“…1, 2) нагадує зміни в спектрі його суміші з m 2 2,9 Gua, однак менші за величиною, що можна інтерпретувати як взаємодію m 2 G з карбоксилатіоном за схемою, подібною до утворюваної m 2 2,9 Gua в комплексі з депротонованою карбоксильною гру пою. За даними ЯМР [46][47][48][49], одноразове метилзаміщення аміногрупи як в m 2 2, 9 Gua, так і в m 2 G призводить до значного підсилення взаємодії з карбоксилат-іоном внаслідок підсилення кислот ності позосталого амінопротона.…”

Section: рис 3 уф спектри поглинання в дмсо: а -M Gua (у) його сумunclassified

“…Аналіз даних УФ спектроскопії та результатів дослідження за допомогою 14 спектроскопії і ЯМР [46][47][48][49] дозволяє запропонувати схеми взаємодії А та В форм m 7 G з нейтральною та депротонова ною формами карбоксильної групи відповідно (рис 2, схеми г та д).…”

Section: рис 4 уф спектри поглинання в дмсо: A-m 7 G (у) його суміunclassified

“…5, а), що свідчить про появу здатності утворювати слабкий комплекс з нейт ральною карбоксильною групою. Оскільки фраг мент 0=C6-N1=C2-NH 2 m 3 Gua подібний до фраг мента цитозину 0=C2-N3=C6-NH 2 , логічно запро понувати схему взаємодії з нейтральною карбо ксильною групою (рис 2, схема IV), аналогічну до схеми взаємодії m Cyt з ас-Asp [46][47][48][49], хоча в останньому випадку спектральні прояви комплексоутворення в багато разів більші.…”

Section: рис 4 уф спектри поглинання в дмсо: A-m 7 G (у) його суміunclassified

“…У ДМСО з домішкою води [42][43][44][45] та у воді [45] Gua утворює специфічний комплекс з депро тонованою карбоксильною групою (карбоксилатіоном). Серію робіт [46][47][48][49][50] присвячено дослід женню специфічності взаємодії низки похідних гу аніну з карбоксильною групою амінокислот та карбоксилат-іоном у зневодненому ДМСО.…”

unclassified

See 4 more Smart Citations

Influence of methylation and interactions with amino acid carboxylic group on UV spectra of purine nucleotide bases and nucleosides in dimethylsulfoxide. 2. Guanine

et al. 2000

View full text Add to dashboard Cite

Вплив метилювання та взаємодії з карбоксильною групою амінокислот на УФ спектри пуринових нуклеотидних основ та нуклеозидів у диметилсульфоксиді. 2. Гуанін А. В. Степанюгін, І. М. Коломієць, А-Л. Потягайло, С. П. Самійленко Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вул. Академіка Заболотного, 150, Київ, 03143, Україна Вивчено УФ спектри поглинання у зневодненому ДМСО похідних гуаніну m 9 Gua, m2 2,9 Gua, m l Gua, m2 l>1 Gua t G, dG, m l G, m 2 G, m 7 G, а також його аналога isoGua. Досліджено та інтерпретовано зміну УФ поглинання похідних Gua в присутності похідних амінокислот, що містять нейтральну карбоксильну групу ас-Asp, ac-Glu, ac-Gly. ac-Asp-OMe ma f-GlyONa і NaAc з депротонованою карбоксильною групою. Показано, що т Gua та m n Gua у зневодненому ДМСО існують як таутомери N9H. Встановлено, що переважна більшість досліджених похідних Gua взаємодіє лише з депротонованою карбоксильною групою, за винятком m n G, isoGua та m 3 Gua, здатних утворю вати комплекси також із нейтральною карбоксильною групою. Розраховано енергетичні харектеристики прототропних таутомеріє Gua та їхніх комплексів з карбоксилат-іоном напівемпіричним методом MNDO/H у вакуумному наближенні

show abstract