Single Nucleotide Polymorphisms in the Gc Gene for Vitamin D Binding Protein in Common Cancers in Thailand

Abstract

Background: This case-control study aimed to determine if there were any associations between the two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in Gc, rs7041 (Asp416Glu) and rs4588 (Thr420Lys) and 3 common cancers (breast, lung and colorectal) in Thai patients. Materials and Methods: Two hundred and eighty two colorectal, 101 breast and 113 lung cancer patients were recruited from one institute during 2011-2013. The controls were age-matched volunteers who had a negative history of index cancers. In addition, vitamin D levels were compared among different genotypes in the 2 SNPs. Results: The minor allele frequencies of rs7041 (G) and rs4588 (A) were 0.32 and 0.24, respectively. Under the dominant model, the study found significant associations between minor-allele genotypes of the SNP rs7041 (TG/GG) and lung cancer (odds ratio [OR] 1.78, 95% CI 1.05-3.03). When subgroup analysis was performed according to sex and age at diagnosis, the study found that the minorallele genotypes of rs7041 (TG/GG) were significantly associated with colorectal cancer in patients whose age at diagnosis was more than 60 years (OR 1.67, 95%CI 1.06-2.61) and the minor-allele genotypes of rs4588 (CA/AA) were significantly associated with colorectal cancer in males aged 60 years or less (OR 2.34, 95%CI 1.25-4.37). When SNP combinations (rs7041-rs4588) were examined, the TT-CA combination had a significant protective

Vitamin D-Related Gene Polymorphisms, Plasma 25-Hydroxy-Vitamin D, Cigarette Smoke and Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) Risk

“…Previous lung cancer studies have reported various results [65,66]. In the current study, it is shown that slight increases in NSCLC risk with rs7041 polymorphisms for rs7041 was a common nonsynonymous SNP in the GC gene.…”

Polymorphisms of Vitamin D Signaling Pathway Genes and Calcium-Sensing Receptor Gene in respect to Survival of Hemodialysis Patients: A Prospective Observational Study

“…This diversity together with low number of affected patients could be a reason why we did not show any associations of tested polymorphisms with a mortality risk due to neoplasms, although such connections were described [35, 48, 49]. …”

Role of vitamin D binding protein (VDBP) gene polymorphisms in lung cancer

“…Yapılan çalışmalarda alel 2'nin makrofaj etkinleştirici özelliğinin daha az olduğu ve bunun sonucunda alel 2'yi taşıyan bireylerin makrofaj işlevinin daha düşük olduğu bildirilmiştir. Bugüne kadar yapıl-mış olan ve VDBP'yi kodlayan gendeki bu polimorfizmlerin (rs7041 ve rs4588) akciğer, [14] meme [15] ve prostat [16] kanseri ile ilişkili olduğunu öne süren çalışmalar olduğu gibi, GC polimorfizmlerinin prostat, [17] kolorektal kanser, [18,19] bazal hücreli karsinom [20] ve melanoma (sadece rs7041 incelenmiş) [21] ile ilişkisi olmadı-ğını bildiren çalışmalar da bulunmaktadır. Literatürde bugüne kadar VDBP polimorfizmi ile akciğer kanseri arasındaki ilişkiyi araştıran çalışma sayısı çok kısıtlı-dır.…”

“…Literatürde bugüne kadar VDBP polimorfizmi ile akciğer kanseri arasındaki ilişkiyi araştıran çalışma sayısı çok kısıtlı-dır. Maneechay ve ark.nın [14] yapmış olduğu çalışmada rs7041 (416 GAT>GAG (Asp>Glu) polimorfizminin akciğer kanseri ile ilişkili olduğu, 113 hastadan 61'inin TG genotipine sahip olduğu, bunun da akciğer kanseri ile ilişkili olduğu gösterilmiştir (p=0.037). rs7041 ve rs4588'deki tek nükleotid polimorfizmleri kombine olarak incelendiğinde ise 1F-2 (TT-CA) genotipine sahip olmanın akciğer kanserine karşı belirgin bir koruyucu etkisi olduğu görülmüştür (p=0.014).…”

“…Ancak aynı çalış-mada her iki genotipin de kolorektal veya meme kanseri ile ilişkisi bulunmamıştır. [14] Bizim çalışmamızda ise 1F-2 genotipine sahip birey sayısı hasta grubunun %7.8'lik, kontrol grubunun ise %4'lük kesimi oluştur-maktaydı. Bu açıdan bakıldığında bu genotiplerin akciğer kanseri ile herhangi bir ilişkisi bulunmadı.…”