Sequencing and identification of expressed Schistosoma mansoni genes by random selection of cDNA clones from a directional library

Abstract

We have initiated a gene discovery program in Schistosoma mansoni based on the technique of Expressed Sequence Tags (ESTs), i.e. partial sequences of cDNAs obtained from single passes in automatic DNA sequences. ESTs can be used to identify genes on the basis of their homology with sequences from other species deposited in DNA or protein databases. Transcripts with sequences without matches in the databases may represent novel parasite-specific genes. This approach has shown to be very efficient and in less than two years a broad range of novel genes has already been ascertained, more than doubling the number of known S. mansoni genes.

Efeitos do pareamento no perfil de expressão gênica do parasita Schistosoma mansoni

“…Em 2000, a primeira biblioteca genômica de Schistosoma foi construída em vetor BAC, a seqüências das extremidades dos insertos de 93 clones foi determinada, e a biblioteca com mais de 21 mil clones foi imobilizada em membranas de nylon e usada para experimentos de hibridização (Le Paslier et al, 2000). Até 2003 haviam sido obtidas 16.813 seqüências de fragmentos de genes expressos (ESTs), um esforço de alguns grupos no mundo, incluindo um consórcio internacional financiado pela OMS (Franco et al, 1995;Machado-Silva et al, 1995;Franco et al, 1997;Rabelo et al, 1997;Santos et al, 1999;Merrick et al, 2003). Almeida et al, 2003).…”