Searching for new resistance sources to tomato yellow leaf curl virus within a highly variable wild Lycopersicon genetic pool

Picó, Belén; Sifres, Alicia; Elía, M.; Díez, Ma José; Nuez, F.

doi:10.1007/s11738-000-0051-0

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“…In contrast with classical R-genes none of the resistances to TYLCV described so far are associated with a HR. Moreover, in almost all TYLCV resistant materials, viral replication occurs [25]–[28]. This also holds true for Ty-1 / Ty-3 , where in the donors ( S. chilense LA1969/LA1932) as well as in a commercial line with a Ty-1 introgression (3761, A.B.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

The Tomato Yellow Leaf Curl Virus Resistance Genes Ty-1 and Ty-3 Are Allelic and Code for DFDGD-Class RNA–Dependent RNA Polymerases

et al. 2013

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Tomato Yellow Leaf Curl Virus Disease incited by Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) causes huge losses in tomato production worldwide and is caused by different related begomovirus species. Breeding for TYLCV resistance has been based on the introgression of multiple resistance genes originating from several wild tomato species. In this study we have fine-mapped the widely used Solanum chilense–derived Ty-1 and Ty-3 genes by screening nearly 12,000 plants for recombination events and generating recombinant inbred lines. Multiple molecular markers were developed and used in combination with disease tests to fine-map the genes to a small genomic region (approximately 70 kb). Using a Tobacco Rattle Virus–Virus Induced Gene Silencing approach, the resistance gene was identified. It is shown that Ty-1 and Ty-3 are allelic and that they code for a RNA–dependent RNA polymerase (RDR) belonging to the RDRγ type, which has an atypical DFDGD motif in the catalytic domain. In contrast to the RDRα type, characterized by a catalytic DLDGD motif, no clear function has yet been described for the RDRγ type, and thus the Ty-1/Ty-3 gene unveils a completely new class of resistance gene. Although speculative, the resistance mechanism of Ty-1/Ty-3 and its specificity towards TYLCV are discussed in light of the function of the related RDRα class in the amplification of the RNAi response in plants and transcriptional silencing of geminiviruses in plants.

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Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

The Tomato Yellow Leaf Curl Virus Resistance Genes Ty-1 and Ty-3 Are Allelic and Code for DFDGD-Class RNA–Dependent RNA Polymerases

et al. 2013

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“…Wild relatives of tomato provide a rich source of quantitative resistances to pests and pathogens (Fernandez-Munoz, Domínguez, & Cuartero, 2000;Huang, Hoefs-van de Putte, Haanstra-van der Meer, Meijer-Dekens, & Lindhout, 2000;Pico, Sifres, Elia, Diez, & Nuez, 2000;Rosello et al, 1999). Quantitative resistance to B. cinerea in wild relatives of S. lycopersicum was reported in infection assays using leaves inoculated with mycelium grown on agar plugs (Urbasch, 1986).…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Partial stem and leaf resistance against the fungal pathogen Botrytis cinerea in wild relatives of tomato

Have

Berloo²,

Lindhout³

et al. 2006

Eur J Plant Pathol

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Tomato (Solanum lycopersicum) is one of many greenhouse crops that can be infected by the necrotrophic ascomycete Botrytis cinerea. Commercial cultivation of tomato is hampered by the lack of resistance. Quantitative resistance has been reported in wild tomato relatives, mostly based on leaf assays. We aimed to identify wild tomato relatives with resistance to B. cinerea based on quantitative assays both on leaves and stem segments, monitoring infection frequency and disease expansion rate as parameters. A quantitative tomato stem segment assay was developed. This stem assay and a previously described leaf assay were used to screen a collection of 22 Solanum accessions. Significant differences in disease parameters were observed among accessions. Resistance to B. cinerea was observed in a number of wild Solanum species, including accessions of S. chilense, S. habrochaites and S. neorickii, both in the leaf assay and the stem segment assay. A number of resistant and susceptible accessions were evaluated as adult plants under greenhouse conditions. The data obtained in greenhouse assays confirmed the leaf and stem disease data. The expression of several defence-related genes was studied in a subset of accessions. There was no apparent correlation between the expression levels of the genes tested and the quantitative resistance level to B. cinerea.

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“…Muchos de estos caracteres podrían tener un interés directo en mejora. Parte de las entradas estudiadas en este trabajo han sido caracterizadas para caracteres de calidad y resistencia a enfermedades (Picó et al, 2000;Sánchez et al, 2000) habiendo encontrado algunas de ellas de interés para su uso en mejora. Diferentes programas de mejora con este objetivo están actualmente en progreso.…”

Section: 3 Análisis De Polimorfismo Y De La Diversidad Genéticaunclassified

Análisis de la variabilidad en las especies del subgénero Eulycopersicon más relacionadas con el tomate cultivado.

Domingos¹

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Queda prohibida la reproducción, distribución, comercialización, transformación, y en general, cualquier otra forma de explotación, por cualquier procedimiento, de todo o parte de los contenidos de esta obra sin autorización expresa y por escrito de sus autores. Impreso en España RESUMENEl Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad (COMAV) de la Universidad Politécnica de Valencia alberga una de las colecciones más importantes de entradas del género Lycopersicon, incluyendo el tomate cultivado (Lycopersicon esculentum, L. esculentum var. cerasiforme) y sus especies silvestres relacionadas (L. cheesmanii, L. pimpinellifolium, L. hirsutum, L. pennellii, L. chmilewskii, L. parviflorum L. peruvianum y L. chilense).A pesar de ser el tomate una de las hortalizas de mayor importancia económica a nivel mundial, siguen existiendo ambigüedades en su taxonomía así como dudas sobre su domesticación. De hecho, se observan en muchas ocasiones formas intermedias entre el tomate cultivado y la variedad botánica cerasiforme, así como entre la forma cerasiforme y la especie L. pimpinellifolium. Igualmente se han detectado formas intermedias entre L. pimpinellifolium y la especie L. cheesmanii, endémica de las islas Galápagos. Estas especies constituyen el subgénero Eulycopersicon, interfértiles con el tomate cultivado. De ellas, la variedad botánica cerasifrome está considerada como el ancestro del tomate y se ha comprobado la existencia de fenómenos de introgresión entre L. pimpinellifolium y el tomate. Las teorías sobre la domesticación del tomate no son únicas, oponiéndose las teorías de Jenkins (1948) Para contribuir a la clarificación de estos aspectos, en la presente Tesis Doctoral se persiguen los siguientes objetivos:1.-Estudio de la variabilidad morfológica y molecular de estas especies 2.-Esclarecimiento de las relaciones filogenéticos entre las especies del subgénero Eulycopersicon.3.-Establecimiento de estrategias de conservación de estas especies y en especial de Lycopersicon pimpinellifolium, para la que se han descrito diferencias importantes en el grado de alogamia.4.-Inicio de la formación de una colección nuclear en la colección de entradas de L. pimpinellifolium del COMAV.Se han ensayado un total de 165 entradas del género Lycopersicon, perteneciendo 48 de ellas a Lycopersicon esculentun var. cerasiforme, 86 a L. pimpinellifolium y 31 a L. esculentum, en las campañas de otoño-invierno durante los años 2000-01 y 2001-02. Para la caracterización morfológica de las plantas se han seguido los descriptores de tomate publicados por el IPGRI. La caracterización molecular se realizó mediante marcadores AFLP. Los datos se han analizado mediante análisis multivariante, realizando Análisis de Componentes Principales y Análisis Cluster. En el análisis de datos cuantitativos se han calculado las distancias euclídeas y se ha empleado el método de agrupamiento UPGMA. La robustez y nivel de fiabilidad se ha medido mediante la técnica de remuestreo bootstrap. Se realizó un análisis de la Varianza (ANOVA) y posterio...

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Searching for new resistance sources to tomato yellow leaf curl virus within a highly variable wild Lycopersicon genetic pool

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The Tomato Yellow Leaf Curl Virus Resistance Genes Ty-1 and Ty-3 Are Allelic and Code for DFDGD-Class RNA–Dependent RNA Polymerases

The Tomato Yellow Leaf Curl Virus Resistance Genes Ty-1 and Ty-3 Are Allelic and Code for DFDGD-Class RNA–Dependent RNA Polymerases

Partial stem and leaf resistance against the fungal pathogen Botrytis cinerea in wild relatives of tomato

Análisis de la variabilidad en las especies del subgénero Eulycopersicon más relacionadas con el tomate cultivado.

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