Screening for and Genetic Analysis on T-DNA-inserted Mutant Pool in Rice

Li, Aihong; Zhang, Yafang; Wu, Changyin; Wen, Tao; Wü, Ray; Dai, Z L; Liu, Guangqing; Zhang, Hongxi; X, Pan

doi:10.1016/s0379-4172(06)60057-7

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“…Malachium aquaticum is the wild vegetable of Caryophyllaceae [10]. In this study, we grew M. aquaticum seedlings under salt stress, and used the different concentrations of ABA to treat M. aquaticum seedlings, to study the effects of ABA on the growth of M. aquaticum seedlings under salt stress.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Effects of Abscisic Acid (ABA) on Growth of Malachium Aquaticum under Salt Stress

Qing¹,

Wang²,

Zhang³

et al. 2016

Proceedings of the 2016 2nd International Conference on Advances in Energy, Environment and Chemical Engineering (AEECE 2016)

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The effects of abscisic acid (ABA) on the growth of Malachium aquaticum under salt stress were investigated through a pot experiment. The results showed that ABA increased the biomass of M. aquaticum. With the increase of ABA concentrations, the root, stem, leaf and shoot biomasses of M. aquaticum increased when the dose of ABA was not more than 5 µmol/L, and decreased when the dose of ABA was more than 5µmol/L. ABA also enhanced the photosynthetic pigment content and antioxidant enzyme activity of M. aquaticum. When applying ABA on M. aquaticum, the soluble sugar content in roots and leaves decreased, and the soluble sugar content in stems increased. Therefore, ABA could promote the growth of M. aquaticum under salt stress.

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Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Effects of Abscisic Acid (ABA) on Growth of Malachium Aquaticum under Salt Stress

Qing¹,

Wang²,

Zhang³

et al. 2016

Proceedings of the 2016 2nd International Conference on Advances in Energy, Environment and Chemical Engineering (AEECE 2016)

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“…Agrobacterium -mediated T-DNA tagging has been developed as a powerful tool for both random and targeted gene disruption; it is increasingly being regarded as the system of choice for many fungi [24]. Agrobacterium -mediated T-DNA tagging is a high-throughput system for identifying and analyzing novel genes [27]–[29], and the key for its success is the discovery of T-DNA-inserted mutants with altered phenotypes.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Cloning of Insertion Site Flanking Sequence and Construction of Transfer DNA Insert Mutant Library in Stylosanthes Colletotrichum

Chen

et al. 2014

PLoS ONE

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Stylosanthes sp. is the most important forage legume in tropical areas worldwide. Stylosanthes anthracnose, which is mainly caused by Colletotrichum gloeosporioides, is a globally severe disease in stylo production. Little progress has been made in anthracnose molecular pathogenesis research. In this study, Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation was used to transform Stylosanthes colletotrichum strain CH008. The major factors of the genetic transformation system of S. colletotrichum were optimized as follows: A. tumefaciens’ AGL-1 concentration (OD600), 0.8; concentration of Colletotrichum conidium, 1×106 conidia/mL; acetosyringone concentration, 100 mmol/L; induction time, 6 h; co-culture temperature, 25°C; and co-culture time, 3 d. Thus, the transformation efficiency was increased to 300–400 transformants per 106 conidia. Based on the optimized system, a mutant library containing 4616 mutants was constructed, from which some mutants were randomly selected for analysis. Results show that the mutants were single copies that could be stably inherited. The growth rate, spore amount, spore germination rate, and appressorium formation rate in some mutants were significantly different from those in the wild-type strain. We then selected the most appropriate method for the preliminary screening and re-screening of each mutant’s pathogenic defects. We selected 1230 transformants, and obtained 23 strains with pathogenic defects, namely, 18 strains with reduced pathogenicity and five strains with lost pathogenicity. Thermal asymmetric interlaced PCR was used to identify the transfer DNA (T-DNA) integration site in the mutant that was coded 2430, and a sequence of 476 bp was obtained. The flanking sequence of T-DNA was compared with the Colletotrichum genome by BLAST, and a sequence of 401 bp was found in Contig464 of the Colletotrichum genome. By predicting the function of the flanking sequence, we discovered that T-DNA insertion in the promoter region of the putative gene had 79% homology with the aspartate aminotransferase gene in Magnaporthe oryzae (XP_003719674.1).

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“…(McElver et al, 2001;Alonso et al, 2003) y en arroz (Oriza sativa; Barakat et al, 2000;Jeon et al, 2000). Por contra, con otros métodos de transformación genética como el bombardeo de particulas, se pueden insertar un mayor número promedio de copias de T-DNA alcanzando valores superiores a 100 insertos (Shou et al, 2004).Con otros métodos de transformación directa se pueden alcanzar promedios de 3 copias de T-DNA con la presencia de un alto número de líneas con entre 4 y 6 insertos (Kohli et al, 1998) diferentes alternativas metodológicas TAIL-PCR (Liu et al, 1995;Li et al, 2006), (SON)-PCR (Antal et al, 2004)…”

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Generación de líneas T-DNA de tomate (Solanum lycopersicum) para la identificación de mutantes de inserción alterados en la morfogénesis y el desarrollo vegetal

López¹

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1.1.1.-Origen, historia y clasificación taxonómicaEl centro de origen del tomate (Solanum lycopersicum L.) se encuentra en la zona Andina ahora rodeada por Colombia, Perú, Chile, Bolivia y Ecuador. El lugar y tiempo en el cual fue domesticado no se conoce con exactitud (Sims, 1980). Sin embargo, existen dos hipótesis en las cuales se plantea que el tomate tiene como posible centro de domesticación México y Perú. En 1886, Alfonse De Candello, coetáneo de Darwin, usó una evidencia lingüística como los nombres "mala peruviana" o "pommi del Perú" (manzana peruana) para considerar a Perú como centro de domesticación. Por otro lado, Jenkis (1948) postuló a México como centro de domesticación, utilizando como justificación que no había evidencia de cultivos de tomate en épocas pre-colombinas en el Sur de América, a diferencia de México. También usó otra evidencia lingüística, pero no está claro que la planta citada como "tomalt" se refiera a tomate o una especie nativa de Physalis (Nesbitt y Tanksley, 2002; Bauchet y Causse, 2007).Recientemente se ha estudiado el genoma de más de mil accesiones de tomate, Solanum lycopersicum var. cerasiforme y Solanum pimpinellifolium y se ha llegado a la conclusión de que el tomate se ha domesticado en dos pasos.El primero habría tenido lugar en el norte de Perú y Ecuador y el segundo habría sido en México (Blanca et al., 2015) En el año 1523 el tomate llegó a Europa. Sin embargo, su consumo fue casi nulo ya que se consideraba una planta tóxica. Los españoles y portugueses lo diseminaron por el resto del mundo gracias a sus colonias ultramarinas. En el siglo XVII el tomate ya se había introducido en la región oriental de Asia y su cultivo a escala comercial comenzó a finales de siglo XIX.El tomate pertenece a la familia de las Solanaceae, la cual contiene más de 3.000 especies, incluyendo plantas de importancia económica, tales como, patata, berenjenas, pimientos, petunias y tabaco. Desde el primer momento en que el tomate cultivado fue introducido a Europa, los botánicos han reconocido su estrecha relación con las especies del genero Solanum y en el siglo XVII se 3 refería al tomate cultivado como S. pomiferum (Luckwill, 1943). Tournefort fue el primero en ubicar al tomate cultivado en el género Lycopersicon. Este autor clasificaba a las especies que presentaban frutos multiloculares dentro del género Lycopersicon y a las especies que presentaban frutos biloculares dentro de género Solanum. Sin embargo, en la actualidad sabemos que las variedades de tomate pueden ser de ambos tipos. En 1753, Linnaeus colocó al tomate en el género Solanum, junto con la patata, con el nombre específico de

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Screening for and Genetic Analysis on T-DNA-inserted Mutant Pool in Rice

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Generación de líneas T-DNA de tomate (Solanum lycopersicum) para la identificación de mutantes de inserción alterados en la morfogénesis y el desarrollo vegetal

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