Research of liver bacteria and lipid profiles on Shaziling pigs

Abstract

进一步 16S rDNA 测序结果显示沙子岭猪与大白猪肝脏细菌 α-多样性(Observed species、shannon、simpson 以及 PD)没有显著差异，但是 β-多样性存在明显分 区(图 1 A-B) ，提示不同代谢类型动物肝脏细菌存在一定差异。在门水平上， 瘦肉型大白猪肝脏优势菌门包括 Proteobacteria(40.13%)、 Firmicutes(25.96%) 和 Bacteroidota(18.84%) ，脂肪型沙子岭猪肝脏优势菌群与大白猪一致，但是 Firmicutes(41.79%)、 Proteobacteria(18.08%)和 Bacteroidota(16.95%)相对 丰度存在差异(图 1C) 。我们进一步比较了门水平上前 10 种细菌在不同代谢类 型动物模型中的丰度差异，发现 Proteobacteria 和 Chlamydiae 丰度在沙子岭猪肝 脏中均显著低于瘦肉型大白猪(P＜0.05) (图 1C) 。在属水平上，我们比较了前 50 种细菌 (图 1D) ， 结果筛选到 14 种显著在沙子岭猪和大白猪肝脏差异的细菌， 其中 Actinobacillus、Gemella、Ralsonia、Rothia、Chlamydia, Faecalibaculum、 Eubacterium_nodatum、Atopobium、Solobacterium 以及 Lachnoanaerobaculum 等 丰度在瘦肉型大白猪肝脏显著富集(P＜0.05) ，而 Cardnerella、Ruminococcus、 Lachnospira 和 Alistipes 等细菌在脂肪型沙子岭猪肝脏显著富集(P＜0.