A pandemia de COVID-19 e as medidas de distanciamento social trouxeram implicações psicossociais para toda a comunidade universitária. Diante disso, o objetivo deste estudo é identificar fatores associados a sinais de ansiedade, depressão e estresse em uma comunidade universitária em regime de distanciamento social, durante a emergência sanitária. Por meio de estudo observacional de corte transversal com caráter quantitativo exploratório, realizado entre abril e maio de 2020, com uso da Escala de Depressão, Ansiedade e Estresse (DASS-21), foi obtida amostra on-line de 1.796 indivíduos. Os resultados de regressão quasi-Poisson demonstram que histórico de distúrbio mental, piora do estado emocional e dificuldades financeiras estão associados a altos escores dos três desfechos. Ainda, praticar atividade que proporciona bem-estar e possuir computador em casa estão associados negativamente a escores altos de depressão. Assim, mudanças do ensino presencial para o remoto podem ter implicações negativas na saúde mental de comunidades universitárias.