Rapid differentiation of Alectoris rufa L., 1758 and Alectoris chukar (Gray, 1830) (Galliformes: Phasianidae) by melting curve analysis of a parathyroid hormone gene SNP

Abstract

Diferenciación rápida de Alectoris rufa Linnaeus, 1758 y Alectoris chukar (Gray, 1830) (Galliformes: Phasianidae) mediante curvas de disociación de un SNP del gen de la hormona paratiroidea Los métodos actuales basados en ADN para identificar los niveles de introgresión en especies cercanas implican la manipulación posterior a la PCR, aumentando el tiempo y coste en el procesado de las muestras. El análisis de curvas de disociación es una técnica que utiliza cebadores especie-específicos. En este trabajo se demuestra que tal análisis resulta muy preciso para la diferenciación de individuos puros de Alectoris chukar y A. rufa, utilizando un SNP del gen de la hormona paratiroidea de una manera simple, rápida y eficiente. Se analizaron setenta y ocho muestras (A. chukar, n=15; A. rufa, n=63), y no se detectaron híbridos. Este método podría ser aplicado en políticas de gestión basadas en el control genético de las perdices reproducidas en granjas y utilizadas en repoblación u otras actividades cinegéticas. AbstractCurrent DNA-based methods for identifying introgression levels of closely related species imply post-polymerase chain reaction manipulations that requires additional time and expenses for sample processing. Melting curves analysis is a technique that uses species-specific primers. Here we show this method to be highly accurate for the rapid differentiation of pure individual partridges of Alectoris chukar and A. rufa species, using a SNP of the parathyroid hormone gene in a simple, rapid and efficient way. Seventy eight individuals were analyzed, (A. chukar, n=15; A. rufa, n=63), and no hybrids were detected. This method should find wide use for the management polices based on strict genetic controls for partridge stocks reproduced in farms and used in restocking or other hunting activities.