Buah naga adalah jenis buah tropis yang kaya dengan zat warna. Warna ini dapat diperoleh dari kulit maupun daging buah naga yang dapat digunakan sebagai pewarna alami dalam mengatasi penggunaan pewarna buatan di masyarakat yang di luar ambang batas sehingga dapat menimbulkan resiko bagi kesehatan. Selain itu, pada buah naga juga terdapat senyawa fungsional dalam bentuk senyawa polifenol yang merupakan sumber antioksidan. Senyawa ini mudah rusak sehinga harus memilih metode ekstraksi yang baik agar dapat dapat mempertahankan senyawa ini. Microwave-Assisted Extraction (MAE) merupakan salah satu metode yang dapat digunakan. Metode ini melakukan ekstrak dengan menggunakan gelombang elektromagnetik. Tujuannya agar kualitas warna yang dihasilkan dapat lebih baik sehingga dapat juga mempertahankan senyawa polifenol yang terdapat dalam buah naga tersebut. Metode dari penelitian ini adalah dengan mengambil nilai ratarata dari setiap pengamatan yang sudah diamati dari 3 sampel buah naga yaitu kulit buah naga merah, daging buah naga merah dan kulit buah naga daging putih. Hasil penelitian didapatkan kualitas warna terbaik berasal dari kulit buah naga daging merah dengan nilai sebagai berikut : polifenol 623,1 mg GAE/100 gram, aktivitas antioksidan 41,18%, antosianin 84 mg/100 gram, betasianin 0,75 mg/100 gram dan warna 21,18.