Polyphasic characterization of Burkholderia gladioli isolated from onion and evaluation of its potential pathogenicity for other crops

Abstract

Los individuos del género <em>Burkholderia</em>, <em>sensu lato</em>, se caracterizan por colonizar diversos nichos ecológicos. Esta investigación tuvo como objetivos caracterizar morfológica, fisiológica, bioquímica y molecularmente a <em>Burkholderia gladioli</em>, aislada de bulbos podridos de cebolla blanca (<em>Allium cepa</em>), y determinar su potencial como patógeno de otras especies vegetales. <em>Burkholderia gladioli</em> promovió, igualmente, la pudrición blanda en bulbos de cebolla morada (<em>A. cepa</em>), tallos de puerro (<em>A. ampeloprasum</em>), inflorescencias de brócoli (<em>Brassica oleracea</em>), cladodios de nopal (<em>Opuntia indica</em>), raíces de zanahoria (<em>Daucus carota</em>) y esporocarpos de champiñón (<em>Agaricus bisporus</em>). <em>Burkholderia gladioli</em> colonizó plantas de frijol (<em>Phaseolus vulgaris</em>) en invernadero y mostró resistencia natural <em>in vitro</em> a productos a base de cobre: cuprimicin agrícola, cuprimicin 500, phyton, oxicloruro de cobre; antibióticos: bactrol, bactriomicin agrícola, kasumin, final bacter, quartz y biológicos: serenade polvo, fungifree y bacterbest. Este estudio reporta por primera vez la caracterización polifásica de <em>B. gladioli</em> en México. Este aislado bacteriano creció a pH 4.0 y 42 °C, lo que podría conferirle habilidad competitiva en suelos ácidos y condiciones semiáridas. Se demostró que tiene un amplio rango de hospederos en condiciones postcosecha, además de ser resistente a diferentes productos usados en campo para el control de fitopatógenos.

Characterization and identification of Burkholderia gladioli causing stalk rot of sweet corn in Thailand

“…Burkholderia gladioli has been reported to have causes ear soft rot in the United States (Lu et al., 2007) and similar diseases in other plants such as rice (Riera‐Ruiz et al., 2014), gladiolus (Yanez et al., 2022), sweet potato (Zhang et al., 2020), saffron (Fiori et al., 2011) and onion (Serret‐Lopez et al., 2020). Furthermore, leaf stripe and stalk rot of corn caused by B. gladioli was first reported in Mexico (Gijon‐Hernandez et al., 2011).…”

“…Therefore, the strain of the bacterium tested (MHSL06) was identified as a strain of Burkholderia gladioli ‐based on the physiology and biochemical characterization. (Serret‐Lopez et al., 2020; Ura et al., 2006; Yabuuchi et al., 1992).…”

Omics sciences potential on bioprospecting of biological control microbial agents: the case of the Mexican agro-biotechnology

“…A nivel intraespecífico, miembros del grupo de B. cereus poseen secuencias del gen 16S ARNr muy similares y genomas altamente conservados (Ehling-Schulz et al, 2019), lo que dificulta su correcta afiliación taxonómica. Otro grupo que evidencia la importancia taxonómica con un enfoque molecular debido a restricciones de caracterización bioquímica, biológica y morfológica es el género Burkholderia (Espinosa-Victoria et al, 2020;Serret-López et al, 2021;.…”

“…En los últimos años, la introducción de diversas estrategias y plataformas de secuenciación de siguiente generación (NGS, por sus siglas en inglés), herramientas genómicas, filogenómicas y bioinformáticas ha contribuido significativamente a una mejor comprensión de la evolución e interacción intraspecific level, members of the B. cereus group have sequences of the 16S rRNA gene that are very similar and highly conserved genomes (Ehling-Schulz et al, 2019), a fact that makes their correct taxonomic affiliation difficult. Another group of taxonomic importance with a molecular approach is the Burkholderia genus, due to biochemical, biological, and morphological characterization restrictions (Espinosa-Victoria et al, 2020;Serret-López et al, 2021;. In recent years, the introduction of various next-generation sequencing strategies and platforms (NGS), as well as genomic, phylogenomic, and bioinformatic tools, have significantly contributed to a better understanding of the microorganism's evolution and interaction with their environment (Jagadeesan et al, 2019).…”