Polymorphism of Interleukin 28 and HCV: Implementation of a method

Abstract

INTRODUZIONEL'infezione da virus dell'epatite C (HCV) colpisce 170 milioni di persone in tutto il mondo (14). Di queste solo il 20-30% guarisce spontaneamente; il rimanente sviluppa un'infezione cronica con rischio di evoluzione a cirrosi ed epatocarcinoma (7,9). Il 50% dei pazienti affetti da epatite C cronica risulta non rispondere alla terapia con αinterferone pegilato e ribavirina (1,2,4,8,15). Recentemente sono stati descritti due polimorfismi (SNPs) in associazione al gene codificante per l'interleuchina 28 (IL-28). In particolare il polimorfismo rs12979860 (C/T), situato 3 kb a monte del gene, risulta associato a una rapida e precoce risposta alla terapia (genotipo C/C) (3, 10-13). Scopo del nostro studio è quello di mettere a punto un metodo rapido e di semplice esecuzione per effettuare lo screening del polimorfismo rs12979860. MATERIALI E METODISono stati analizzati i campioni di sangue provenienti da 329 pazienti HCV positivi di cui 46 coinfetti con HIV. Il DNA è stato estratto da leucociti di sangue periferico utilizzando il kit commerciale di estrazione QIAsymphony DNA mini kit. I campioni sono stati analizzati attraverso High Resolution Melting (HRM) che consente un semplice e rapido screening del polimorfismo rs12979860 (5, 6). L'analisi è stata effettuata su Rotor Gene Q (Qiagen) utilizzando una Master Mix HRM 1X (Qiagen), contenente: deossinucleotidi trifosfato (dNTPs), HRM PCR Buffer, Q solution e Eva