Polygenic Risk Scores in Schizophrenia: Ready for the Real World?

Binder, Elisabeth B.

doi:10.1176/appi.ajp.2019.19080825

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“…The odds ratio for top vs bottom decile are large, ranging from 14 for PC+T to 30 for MegaPRS for SCZ and 3 for PC+T to 3.7 for SBayesR for MDD. While these top vs bottom decile odds ratios (Figure 1C and S2C) are much larger than the odds ratio obtained by using PGS to screen a general population (Figure 1D and 2D) or patients in a healthcare system to identify people at high risk (38,39), these comparisons are useful for research purposes, which could, for example, make cost-effective experimental designs focussing on individuals with high vs low PGS (40). The odds ratio of top 10% vs middle 10% are much less impressive, up to median of 6 for SCZ and 2 for MDD, but more fairly represents the value of PGS in population settings.…”

Section: Resultsmentioning

confidence: 75%

A Comparison of Ten Polygenic Score Methods for Psychiatric Disorders Applied Across Multiple Cohorts

Ni¹,

Zeng²,

Revez³

et al. 2021

Biological Psychiatry

Self Cite

130

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Section: Resultsmentioning

confidence: 75%

A Comparison of Ten Polygenic Score Methods for Psychiatric Disorders Applied Across Multiple Cohorts

Ni¹,

Zeng²,

Revez³

et al. 2021

Biological Psychiatry

Self Cite

130

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“…Darüber hinaus gibt es bei der klinischen Anwendung von PRS verschiedene Aspekte zu berücksichtigen. So können die auf Datengrundlage einer Population (Abstammung), einer Altersklasse oder eines Geschlechts ermittelten PRS nicht unmittelbar auf eine andere Population (Binder, 2019;Márquez-Luna, Loh, South Asian Type 2 Diabetes [SAT2D], SIGMA Type 2 Diabetes Consortium & Price, 2017), andere Altersklassen (Bradfi eld et al, 2012;Felix et al, 2016;Helgeland et al, 2019;Winkler et al, 2015) oder das andere Geschlecht (Pulit et al, 2019;Yengo et al, 2018) übertragen werden. Darüber hinaus berücksichtigen PRS keine Kopienzahlvarianten (engl.…”

Section: Whole-genome Und Whole-exome Sequencingunclassified

Ebenen der genetischen Analyse komplexer Phänotypen am Beispiel der Anorexia nervosa und der Varianz des Körpergewichts

Hirtz

Zheng

Rajcsanyi

et al. 2022

Zeitschrift für Kinder- und Jugendpsychiatrie und Psychotherapi

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Zusammenfassung. Genetische Varianten beeinflussen die Gewichtsregulation und die Entwicklung von Essstörungen. Zunächst haben familienbasierte, sogenannte formalgenetische Studien den erblichen Anteil an der Gewichtsregulation und an der Ätiologie von Essstörungen beleuchtet. In einer Vielzahl von Studien zeigten sich sowohl für die Varianz des Körpergewichts als auch für die Entstehung von Essstörungen Erblichkeitsschätzer (Heritabilitätsraten) von über 50 %. Mit diesem Wissen begab man sich in den 90er-Jahren des letzten Jahrhunderts auf die Suche nach den zugrundeliegenden Genen (genauer: genetischen Varianten), die das Körpergewicht, das Essverhalten oder beide Phänotypen auf Grundlage geteilter Mechanismen beeinflussen. Zunächst wurden Kandidatengenstudien durchgeführt. Dabei untersuchte man auf Grundlage unterschiedlicher, v. a. aber pathophysiologisch plausibler Überlegungen Gene mit hoher Relevanz für die untersuchten Phänotypen. Dieser Ansatz war für Essstörungen nicht sehr erfolgreich, für die Gewichtsregulation konnte eine Handvoll Gene identifiziert werden. Verbunden mit großen methodischen Fortschritten in der genetischen Forschung und v. a. der Etablierung sogenannter genomweiter Assoziationsstudien (GWAS) Anfang der 2000er-Jahre konnten bislang über 1000 Varianten/Genorte detektiert werden, die das Körpergewicht beeinflussen. Für die Essstörung Anorexia nervosa (AN) sind aktuell acht solcher Genorte beschrieben. Diese Ergebnisse, aber auch aktuelle Ansätze zu phänotypübergreifenden Analysen lassen Einblicke in die komplexe Regulation des Körpergewichtes zu und haben zudem unerwartete Pathomechanismen für AN aufgezeigt.

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“…The current most powerful PS for a psychiatric condition exists for schizophrenia, a debilitating condition characterised by recurrent episodes of psychosis. 9 Schizophrenia is believed to have a heritability of 80%, 10 meaning 80% of variance in population incidence is due to genetics. Given the ultimate limit to the power of PS is heritability, schizophrenia’s high heritability makes it a good candidate for reliable prediction.…”

Section: Preimplantation Genetic Diagnosis and Reproductionmentioning

confidence: 99%

Three models for the regulation of polygenic scores in reproduction

Munday

Savulescu

2021

J Med Ethics

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The past few years have brought significant breakthroughs in understanding human genetics. This knowledge has been used to develop ‘polygenic scores’ (or ‘polygenic risk scores’) which provide probabilistic information about the development of polygenic conditions such as diabetes or schizophrenia. They are already being used in reproduction to select for embryos at lower risk of developing disease. Currently, the use of polygenic scores for embryo selection is subject to existing regulations concerning embryo testing and selection. Existing regulatory approaches include ‘disease-based' models which limit embryo selection to avoiding disease characteristics (employed in various formats in Australia, the UK, Italy, Switzerland and France, among others), and 'laissez-faire' or 'libertarian' models, under which embryo testing and selection remain unregulated (as in the USA). We introduce a novel 'Welfarist Model' which limits embryo selection according to the impact of the predicted trait on well-being. We compare the strengths and weaknesses of each model as a way of regulating polygenic scores. Polygenic scores create the potential for existing embryo selection technologies to be used to select for a wider range of predicted genetically influenced characteristics including continuous traits. Indeed, polygenic scores exist to predict future intelligence, and there have been suggestions that they will be used to make predictions within the normal range in the USA in embryo selection. We examine how these three models would apply to the prediction of non-disease traits such as intelligence. The genetics of intelligence remains controversial both scientifically and ethically. This paper does not attempt to resolve these issues. However, as with many biomedical advances, an effective regulatory regime must be in place as soon as the technology is available. If there is no regulation in place, then the market effectively decides ethical issues.

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Polygenic Risk Scores in Schizophrenia: Ready for the Real World?

Cited by 13 publications

References 12 publications

A Comparison of Ten Polygenic Score Methods for Psychiatric Disorders Applied Across Multiple Cohorts

A Comparison of Ten Polygenic Score Methods for Psychiatric Disorders Applied Across Multiple Cohorts

Ebenen der genetischen Analyse komplexer Phänotypen am Beispiel der Anorexia nervosa und der Varianz des Körpergewichts

Three models for the regulation of polygenic scores in reproduction

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