Pitfalls in prognostic factor studies

Metze, Konradin

doi:10.1111/j.1600-0560.2008.01177.x

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“…Since we were dealing with 256 gray levels, binarization would be arbitrary and reduce the information content [10], [37], [38]. Therefore we decided not to binarize, but to apply the Minkowski-Bouligand method extended to pseudo-3D images [10], [39], [40], [41].…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Fractal Characteristics of May-Grünwald-Giemsa Stained Chromatin Are Independent Prognostic Factors for Survival in Multiple Myeloma

et al. 2011

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BackgroundThe use of computerized image analysis for the study of nuclear texture features has provided important prognostic information for several neoplasias. Recently fractal characteristics of the chromatin structure in routinely stained smears have shown to be independent prognostic factors in acute leukemia. In the present study we investigated the influence of the fractal dimension (FD) of chromatin on survival of patients with multiple myeloma.MethodologyWe analyzed 67 newly diagnosed patients from our Institution treated in the Brazilian Multiple Myeloma Study Group. Diagnostic work-up consisted of peripheral blood counts, bone marrow cytology, bone radiograms, serum biochemistry and cytogenetics. The International Staging System (ISS) was used. In every patient, at least 40 digital nuclear images from diagnostic May-Grünwald-Giemsa stained bone marrow smears were acquired and transformed into pseudo-3D images. FD was determined by the Minkowski-Bouligand method extended to three dimensions. Goodness-of-fit of FD was estimated by the R2 values in the log-log plots. The influence of diagnostic features on overall survival was analyzed in Cox regressions. Patients that underwent autologous bone marrow transplantation were censored at the day of transplantation.Principal FindingsMedian age was 56 years. According to ISS, 14% of the patients were stage I, 39% were stage II and 47% were stage III. Additional features of a bad prognosis were observed in 46% of the cases. When stratifying for ISS, both FD and its goodness-of-fit were significant prognostic factors in univariate analyses. Patients with higher FD values or lower goodness-of-fit showed a worse outcome. In the multivariate Cox-regression, FD, R2, and ISS stage entered the final model, which showed to be stable in a bootstrap resampling study.ConclusionsFractal characteristics of the chromatin texture in routine cytological preparations revealed relevant prognostic information in patients with multiple myeloma.

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Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Fractal Characteristics of May-Grünwald-Giemsa Stained Chromatin Are Independent Prognostic Factors for Survival in Multiple Myeloma

et al. 2011

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“…O valor da quantificação das regiões organizadoras de nucléolos como fator prognóstico em pacientes com mieloma é questão de debate, com resultados conflitantes relatadas pelos diferentes grupos de estudo (Papadhimitriou et al, 2000). As técnicas com impregnação da prata são, por vezes, de difícil controle e isto pode provocar resultados variados, o que, evidentemente, pode interferir na avaliação quantitativa (Mello et al,2008;Metze, 2009;Metze et al, 2009;Kayser, 2007). Goasguen et al (1999), desenvolveram um protocolo de análise baseado em critérios morfológicos das células do mieloma em lâminas de rotina.…”

Section: Discussionunclassified

“…Em alguns estudos, a dimensão fractal é medida após a binarização da imagem, isto é transformar a imagem em duas categorias, como preto e branco, mas como estávamos lidando com 256 níveis de cinza da cromatina, o processo de binarização seria algo arbitrário e reduziria o conteúdo da informação (Metze, 2009). Para poder utilizar todas as informações da estrutura da cromatina, decidimos não binarizar para aplicarmos o método de Minkowski -Bouligand.…”

Section: Análise De Texturaunclassified

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O valor prognóstico das características fractais da cromatina nuclear no mieloma múltiplo

Ferro¹

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Ao meu irmão Alessandro, que em todos os momentos da minha vida sempre esteve comigo Dedico esta dissertação vi Agradecimentos À Deus, pela vida, por me iluminar e me proporcionar tantas oportunidades. Aos meus pais, não tenho palavras para agradecer por tudo que sempre fizeram por mim. Qualquer coisa que eu disser vai ser pouco frente à importância que vocês têm em minha vida. Obrigada pelo carinho, incentivo, compreensão, exemplo de vida, por tudo o que sempre fizeram por mim. Ao meu irmão Alessandro, por ser prestativo, pelo apoio, pelas nossas conversas e por sempre poder contar. À minha avó Catharina e aos meus outros avós: Alcides, Manoel e Umbelina in Memorian Tia Rosa, tio Antônio e primas: Gisele e Regiane, por me receberem em seu lar com tanto amor, no inicio do mestrado, pois serei grata para sempre. As minhas tias, tios e primos por se interessarem pelo conteúdo da minha dissertação, sempre curiosos, perguntando, ouvindo com toda atenção e entusiasmados. Ao Oscar, por ter estado ao meu lado durante quase todo o tempo desta minha caminhada, me incentivando. Ao orientador Prof. Dr. Konradin Metze, por me aceitar, pela confiança, constante incentivo, ensinamentos e auxílio; contribuindo de forma essencial desde a primeira ideia até a concretização deste trabalho. À prof. Dra. Irene, por sua co-orientação, pelos ensinamentos, dedicação e disposição em me ajudar. vii As estagiárias e funcionárias do laboratório de hematologia do hemocentro, por serem prestativas. À Mônica, da hematologia, pela ajuda imprescindível na aquisição das imagens e levantamento dos dados clínicos dos pacientes. Aos funcionários do departamento de Anatomia Patológica e do Programa de Pósgraduação em Fisiopatologia Médica, pela ajuda, sempre que necessário. Ao Randall, por sua paciência para ensinar e pela criação dos softwares. À grande amiga Gislaine, pelo companheirismo, por estar sempre disposta a ajudar, e pela amizade sincera. A Eliana e Marina, da estatística do hemocentro, pela ajuda na busca dos dados dos pacientes. Sérgio e Rosana do Núcleo de Medicina e cirurgia experimental, pela amizade, ajuda nos experimentos e confecção de lâminas. Aos amigos do grupo de pesquisa, pela amizade e trocas de experiências.

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