Phylogeny of Neotropical oryzomyine rodents (Muridae: Sigmodontinae) based on the nuclear IRBP exon

Weksler, Marcelo

doi:10.1016/s1055-7903(03)00132-5

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“…The divergence time between hosts species was estimated based on 2 independent fossil calibrations, namely, the NecromysAkodon split (4 MYA) (Reig, 1987) and the earliest fossil record of Oligoryzomys flavescens in South American (1.5 MYA) (Pardiñas et al 2002). The host phylogenetic tree obtained in this study resembles other proposed sigmodontine phylogenetic trees (e.g., D 'Elía, 2003;Weksler, 2003). The few topological differences observed among our phylogeny and these early sigmodontine phylogenies may be the result of the smaller number of species used in this study for the construction of the host phylogenetic tree.…”

Section: Estimates Of the Divergence Times Of Host Speciessupporting

confidence: 78%

Similarities among ectoparasite fauna of sigmodontine rodents: phylogenetic and geographical influences

2012

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S U M M A R YPhylogenetic and geographical overlaps in host distributions influence the compositional similarity of ectoparasite fauna in a host-parasite system. In these systems, hosts that are more closely related (phylogenetically) are expected to share more parasitic species than more distantly related hosts. Similarly, hosts sharing a larger geographical distribution overlap are expected to have similar ectoparasites. This study investigated the influence of phylogeny (divergence time) and geographical overlap of some neotropical sigmodontine rodent species on the similarities among their ectoparasite fauna (Mesostigmata and Siphonaptera), using a partial Mantel test. Divergence time was the only significant factor that influenced the similarity among the ectoparasites, when mites and fleas were analysed together. Host species that had diverged more recently displayed ectoparasite fauna that were similar. The similarities of the flea species showed similar results in both separate and joint analyses, but neither phylogenetic nor geographical overlap influenced the similarity in mite species. Fleas were shown to be more host-specific than were mesostigmate mites, probably because of the increased influence of host phylogeny.

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Section: Estimates Of the Divergence Times Of Host Speciessupporting

confidence: 78%

Similarities among ectoparasite fauna of sigmodontine rodents: phylogenetic and geographical influences

2012

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“…In the last two decades, phylogenetic analyses using either morphological or molecular data or both were used to set the limits and contents of these groups and determine the timing of their diversification (e.g., Braun 1993;Smith and Patton 1999;Steppan 1995;D'Elía 2003b;Pacheco 2003;Weksler 2003;D'Elía et al 2003, D'Elia et al 2006aMartínez et al 2012;Parada et al 2013;Salazar-Bravo et al 2013). Those studies caused a number of major reconsiderations on the limits and contents of these groups.…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

The phylogenetic position of the enigmatic Atlantic forest-endemic spiny mouse Abrawayaomys (Rodentia: Sigmodontinae)

et al. 2013

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Background: The phylogenetic position of the sigmodontine genus Abrawayaomys, historically assigned to the tribe Thomasomyini or considered a sigmodontine incertae sedis, was assessed on the basis of nuclear and mitochondrial DNA sequences obtained from four individuals from different localities in the Atlantic forest of Brazil. Sequences of Abrawayaomys were analyzed in the context of broad taxonomic matrices by means of maximumlikelihood (ML) and Bayesian analyses (BA). Results: The phylogenetic position of Abrawayaomys differed depending on the gene analyzed and the analysis performed (interphotoreceptor retinoid-binding protein (IRBP) ML: sister to Thomasomyini; IRBP BA: sister to Akodontini; cytochrome (Cyt) b ML: sister to Neotomys; and Cyt b BA: sister to Reithrodontini). With the sole exception of the BA based on Cyt b sequences, where the Abrawayaomys-Reithrodon clade had strong support, all sistergroup relationships involving Abrawayaomys lacked any significant support.

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“…Tal grado de anidamiento también se produce de forma independiente, en fi las y columnas dentro de la matriz (Tabla 3). , 2003, Teta et al 2004, Pardiñas 2008, Voss & Weksler 2009, Tur vey et al 2010, Zijlstra et al 2010, Percequillo et al 2011, siendo los procesos que explican la presencia de una mayor riqueza en zonas de bajas latitudes (i.e. Zona Amazónica), con una disminución monotónica hacia el sur y norte de Sudamérica, aún desconocidos.…”

Section: Resultsunclassified

“…Aunque es posible encontrar una gran variedad de estudios realizados en esta tribu con distintos propósitos, principalmente con respecto a su sistemática, taxonomía y biogeografía (e.g., Reig 1984, Gallardo & Palma 1990, Engel et al 1998, Pardiñas et al 2004, Pardiñas & Teta 2005, Weksler 2006, Almeida et al 2007, Percequillo et al 2011. Si bien la mayoría de los estudios actuales se han centrado en esclarecer la monofi lia y composición de la tribu (Voss & Carletton 1993, Steppan 1995, Weksler 2003, relaciones filogenéticas de los nodos internos (Carletton & Olsson 1999, Smith & Patton 1999, Bonvicino & Moreira 2001, Weksler 2003, Voss & Weksler 2009), delineación de gr upos de géneros (Voss & Carletton 1993, Voss et al 2002) y descripción de fósiles (Carletton & Olsson 1999, Pardiñas 2008, Turvey et al 2010, Zijlstra et al 2010, estos no han asociado la biodiversidad obser vada de forma explícita en un contexto geográfi co. Ruggiero et al (1998) a través del estudio de mamíferos sudamericanos, plantean la impor tancia de considerar la estr uctura biogeográfica en análisis de gradientes de distribución de especies, destacando la extensa cordillera de los Andes como estructurador de su distribución. Par ticularmente, para Sigmodontinos Pardiñas & Teta (2005), analizan el efecto de las barreras geográfi cas, siendo la formación de los Andes de gran importancia para los procesos de especiación de estos roedores (Reig 1980, 1984, Weksler 2006.…”

Section: Introductionunclassified

Patrones de distribución geográfica de la riqueza de especies de roedores de la tribu Oryzomyini (Rodentia: Sigmodontinae) en Sudamérica: Evaluando la importancia de los procesos de colonización y extinción

Valencia-Pacheco¹,

Avaria‐Llautureo²,

Muñoz-Escobar³

et al. 2011

Rev. chil. hist. nat.

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RESUMENLa tribu de roedores Oryzomyini es la más diversa dentro de la subfamilia Sigmodontinae. Está constituida por 120 especies y 31 géneros, de las cuales 83 son endémicas del continente sudamericano. Este grupo exhibe una extensa distribución que abarca toda la región Neotropical, caracterizada por la presencia de una mayor riqueza en la Amazonia con una disminución monotónica hacia el sur y norte de Sudamérica. Este es un patrón bastante conocido en la mayoría de los taxones, por lo que se han propuesto varios mecanismos causales. Sin embargo, se desconocen los mecanismos que dan cuenta de este gradiente latitudinal en la riqueza de especies de Oryzomyini. Debido a que estas especies son originarias de la Amazonia, y que a través de su historia colonizaron ambientes nuevos y más variables (sur y norte), se evaluó la hipótesis fuente-sumidero, mediada por procesos de colonización y extinción, como potencial explicación al patrón de riqueza observado. Para evaluar esta hipótesis se reunió una base de datos de distribución y riqueza de especies por grado de latitud para todo el continente sudamericano. Posteriormente se evaluó el grado de anidamiento mediante los índices de T (temperatura), BR (discrepancia) y NODF. Nuestros resultados evidenciaron un grado de anidamiento signifi cativo en la distribución de Oryzomyini, y un anidamiento signifi cativo separadamente en fi las y columnas de la matriz. Por lo tanto, se concluye que la dinámica fuente-sumidero afecta el patrón de distribución de la riqueza de roedores Oryzominos, a través de un proceso de colonización durante su expansión en Sudamérica que fue mediado por los rangos de tolerancia de las especies. Finalmente, las especies menos tolerantes se habrían extinguido, lo que determinaría un menor número de especies hacia el sur y norte de la Amazonia.Palabras clave: anidamiento, biodiversidad, gradiente latitudinal, hipótesis fuente-sumidero, macroecología. ABSTRACTThe Oryzomyini rodent tribe is the most diverse taxon within the Sigmodontinae subfamily. This tribe includes 120 species and 31 genera, of which 83 are endemic to the South American continent. This tribe presents a wide distribution, covering the entire Neotropical biogeographic province, and is characterized by the presence of greater richness in the Amazonian area, with a monotonic decrease towards the south and north of South America. This pattern is wellknown in many taxa, for which various causal mechanisms have been proposed. However, the mechanisms that explain this pattern of species richness along the latitudinal gradient in the Oryzomyini tribe are unknown. Given that these species are native to Amazonia, and that throughout their history they colonized new and more variable environments (towards the south and north), we evaluated the source-sink hypothesis, mediated by processes of colonization and extinction, as a potential explanation for the observed pattern of richness. To test this hypothesis we built a database of species' distribution and richness every one degree of latitude...

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Phylogeny of Neotropical oryzomyine rodents (Muridae: Sigmodontinae) based on the nuclear IRBP exon

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Similarities among ectoparasite fauna of sigmodontine rodents: phylogenetic and geographical influences

Similarities among ectoparasite fauna of sigmodontine rodents: phylogenetic and geographical influences

The phylogenetic position of the enigmatic Atlantic forest-endemic spiny mouse Abrawayaomys (Rodentia: Sigmodontinae)

Patrones de distribución geográfica de la riqueza de especies de roedores de la tribu Oryzomyini (Rodentia: Sigmodontinae) en Sudamérica: Evaluando la importancia de los procesos de colonización y extinción

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