Phylogenetic diversity of microbial communities of the Posolsk Bank bottom sediments, Lake Baikal

Diversity of NC10 Bacteria and ANME-2d Archaea in Sediments of Fault Zones at Lake Baikal

“…There was a greater variety of sulfate-reducing bacteria and a high rate of sulfate reduction in the bottom sediments of the methane seep PB. Sulfate-reducing bacteria from this site accounted for 9.2-9.5% of all analyzed 16S rRNA gene sequences [59], among which members of the genus Desulfosporosinus were detected by molecular methods [55]. The range of sulfate-reduction rates was 1.2 nM in the sediments below 60 cm and 1000 nM in the surface layer (0-2 cm).…”

“…The structure of microbial communities was previously studied in deep sediments of methane seeps and mud volcanoes in Lake Baikal. However, no marine uncultivated anaerobic methanotrophic archaea of the ANME clusters were found either in surface sediments or zones of GH occurrence [57,59,60,68,73]. The absence of ANME clusters that are typical for marine ecosystems is understandable since in deep sediments of some gas-saturated areas (oil seeps and methane seeps), the concentration of sulfate ions is comparable with the reference values (up to 82 µM) [55,56], which is insufficient for the occurrence of geochemically significant sulfate-dependent AOM.…”

“…The process of AOM in deep sediments of Lake Baikal was detected by radioisotope techniques, with a maximum that was usually close to the GH layers, as well as by the shape of methane profile with depth typical for AOM [56,57]. Despite high methane concentrations in deep sediments of some sites of Lake Baikal (up to 15000 µM) that are sufficient to carry out of AOM [58], members of methane-oxidizing ANME clusters were not detected [57,59,60]. In this regard, it was suggested that the process could be carried out in methane-enriched freshwater lake sediments by other microorganisms, including ANME-2d archaea and NC10 bacteria.…”

Thermophilic facultative anaerobic bacteria of the genus Geobacillus from bottom sediments of Lake Baikal

“…В исследованных библиотеках генов 16S рРНК представители этого филума составляли не более 2 % от общего количества последовательностей (Kadnikov et al, 2012;Zemskaya et al, 2015). Лишь в поверхностных осадках метанового сипа «Посольская Банка» содержание представителей филума Firmicutes составляло 4.2 %, в глубинных -8.9 % от общего количества последовательностей (Chernitsyna et al, 2016). Появление в поверхностных психрофильных осадках озера Байкал термофильных микроорганизмов р. Geobacillus может быть следствием миграции газонасыщенных минерализованных флюидов, которые увлекают с собой из глубинных в поверхностные слои осадков не только диатомовые водоросли (Klerx et al, 2003), но и жизнеспособные микроорганизмы с неизвестным метаболизмом.…”

“…В поверхностных осадках установлено присутствие хемолитотрофных, хемоавтотрофных и анаэробных органотрофных микроорганизмов, участвующих в циклах азота, углерода и серы. Особенности состава микробных сообществ в этом районе обеспечивается наличием особых путей миграции газосодержащих флюидных потоков с которыми в холодные поверхностные осадки могут поступать глубинные термофильные прокариоты (Naudts et al, 2012;Chernitsyna et al, 2016). Для подтверждения этой гипотезы мы провели поиск термофильных, анаэробных микроорганизмов в районе выхода газосодержащих флюидных потоков района метанового сипа «Посольская Банка».…”