Performance Evaluation of Parallel Inference of Large Phylogenetic Trees in Santos Dumont Supercomputer: A Practical Approach

Ocaña, Kary; Osthoff, Carla; Coelho, Micaella; Galheigo, Marcelo; Canuto, Isabela; Oliveira, Douglas E. M. de; Oliveira, Daniel de

doi:10.1007/978-3-030-41005-6_31

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“…A plataforma multiusuário do Bioinfo-Portal fornece uma interface personalizada fácil de usar e que permite acessar e usufruir dos recursos de CAD especializados que suportem execuções de bioinformática paralelas e distribuídas em grande escala. Bioinfo-Portal registra o processo e a proveniência dos dados para melhor apoiar a reprodutibilidade computacional [Ocaña et al 2019b]. A tarefa de desenho das camadas propostas do Bioinfo-Portalé um processo contínuo e iterativo, planejamos processos de melhoria contínua.…”

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A Arquitetura do Supercomputador SDumont e os Desafios da Pesquisa Brasileira na Área de Computação de Alto Desempenho

Osthoff¹,

Herrera²,

Teixeira³

et al. 2020

Anais Da XI Escola Regional De Alto Desempenho De São Paulo (ERAD-SP 2020)

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O supercomputador Santos Dumont é o quarto maior da América Latina segundo a lista TOP500 com um total de 5.1 petaflops. Ele está hospedado no Laboratório Nacional de Computação Científica (Petrópolis, Brasil), uma unidade de pesquisa do Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação do Brasil. Neste trabalho apresentamos as principais caracterı́sticas do supercomputador, suas áreas e projetos de pesquisa envolvidos, software e portais cientı́ficos acoplados nele, trabalhos em andamento do nosso grupo para otimizar as execuções e informações gerais a usuários potenciais que pretendam submeter projetos nas chamadas para o uso do Santos Dumont.

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