Objetivo: Realizar validação de conteúdo e constructo de protocolo de organização de fluxo de cuidado domiciliar à criança com necessidades especiais de saúde. Métodos: Pesquisa metodológica para validação de instrumento de organização de fluxo, por comitê constituído de oito juízes, utilizando-se a técnica Delphi. Os dados foram coletados por formulário on-line em 2020. Foi feita análise estatística do índice de validade de conteúdo, do coeficiente Kappa e da confiabilidade pelo alfa de Cronbach. Resultados: Na primeira avaliação do instrumento, 24 (77%) dos 31 itens obtiveram 80% de concordância. Após ajustes indicados pelos juízes, na segunda rodada, oito dos 11 itens com concordância baixa anterior apresentaram índice de validade de conteúdo de 100% e três de 83,3%. O alfa de Cronbach foi 0,789, sendo considerado substancial, e o coeficiente Kappa foi 83,64%, sendo classificado como excelente.Conclusão: O protocolo foi considerado validado e pode ser utilizado para uniformização da transição das crianças com necessidades especiais de saúde para a atenção domiciliar.