PERAN miRNA-21 PENEKAN GEN PTEN PENSIYALAN PI3K/AKT PADA KANKER KOLOREKTAL

Abstract

Kanker kolorektal merupakan salah satu penyakit penyebab kematian tertinggi didunia yang disebabkan oleh berbagai faktor seperti mutasi genetik, epigenetik, disregulasi oleh jalur sinyal komunikasi dan mikrobiota usus. Adanya mutasi genetik dan epigenetik menyebabkan hilangnya ekspresi dan fungsi dari PTEN (Phosphatase and TENsin homolog) dimana aktivasi yang terus menerus dari kaskade pensinyalan intraseluler PI3K/Akt yang terlibat dalam karsinogenesis kolorektal. Penanganan masalah tersebut yaitu menggunakan miRNA-21 yang berperan penting dengan menekan gen PTEN penanda biologis yang berguna untuk diagnosis dan pengobatan pada kanker kolorektral. Penelitian bertujuan untuk menentukan pengikatan spesifik miRNA-21 dengan gen PTEN yang berperan dalam kanker kolorektal berdasarkan nilai ∆Ghybrid dan Logistic Probability. Sekuens lengkap gen PTEN diperoleh dari FASTA NCBI dan data CDS diperoleh dari Refseq. Prediksi pengikatan miRNA-21 matur dengan gen PTEN dilakukan menggunakan website StarMir Sfold 2.2. Hasil prediksi pengikatan miRNA-21 dengan 1 target diperoleh 296 model pengikatan. Pengikatan spesifik dilihat dari ∆Ghybrid -23,600 dan logistic probability 0,818 antara ikatan gen PTEN dengan has miR-21-5p pada CDS seedless posisi 3627-3653 dibuktikan dengan nilai ∆Ghybrid paling rendah dari semua ikatan yang terjadi.