Pathology and biobanking

Abstract

Biobanks are units where high quality and long-term protection of biomaterials is maintained. This system, in which biological materials and data are systematically recorded and stored, is a unique resource for the study of the pathophysiology of disease, the development of diagnostic biomarkers, and working with human tissues for the potential discovery of targeted therapeutic agents. At this point, the pathology unit plays a unifying and complementary role between the clinical and core disciplines and offers optimal management of the patients' biomaterials for diagnostic and research projects. The aim of this article is to present general information with regard to a biobank constructed for the storage of tumor tissue and blood biospecimens. Ethical issues (informed consent, protection of confidentiality and privacy, and secondary use of biospecimens) and the information technology system (collection, systematic recording, backup and protection of clinical information) are important issues in biobanking. The selection of freezers to be used in storage (mechanical freezers, liquid-vapor nitrogen tanks), and if mechanical freezers are preferred the establishment of the relevant infrastructure and support team (such as additional power units for protection from power outages), the preservation of materials by aliquoting in different freezers, ensuring financing so as to afford the cost of the infrastructure, and implementation of all these dynamics while adhering to international guidelines are of the utmost importance.

Biobancos en los servicios de anatomía patológica en Costa Rica: un análisis bioético y biojurídico

“…7,11 Por su parte, toda información del individuo que se encuentre en un biobanco se debe considerar como privada y estará regulada por su consentimiento, las decisiones que tomen los investigadores, el CEC de relevancia y las entidades del gobierno pertinentes en temáticas de investigación biomédica. 1 Propiamente en anatomía patológica una de las controversias de mayor peso ha sido definir cuando es necesaria la autorización específica del paciente y en qué casos se puede omitir, esto con relación al uso del material biológico remanente que se recolecta para efectuar procedimientos diagnósticos con implicaciones clínicas, para su posterior uso en investigaciones de índole biomédico. 7 En materia de biobancos, la protección de la información de las personas está ligada a los principios establecidos para la conservación y manejo de muestras biológicas, por lo cual las diferentes instancias interesadas en el establecimiento de un biobanco deben adoptar un modelo de consentimiento informado que englobe las características anteriormente mencionadas, según lo establezcan las directrices de cada nación y el marco jurídico internacional, ya que actualmente no se ha implementado un documento estándar para el consentimiento informado.…”

“…Disponible en: https://thepathologist.com/insidethe-lab/bio-banking-on-pathologys-future). 1 Los hospitales, universidades y diferentes instituciones de investigación biomédica son las entidades involucradas en la implementación de biobancos. 2 Propiamente en el área de anatomía patológica, los biobancos se establecen como una herramienta cuyo objetivo es almacenar y utilizar el material biológico humano restante de estudios diagnósticos en pacientes vivos o provenientes de autopsias para estudios posteriores.…”

“…Debido a los avances científicos y tecnológicos que se han desarrollado en los últimos años, los servicios de anatomía patológica han experimentado un cambio significativo en las funciones que se desempeñan, pasando de observar las alteraciones de la morfología celular y la fisiopatología de las enfermedades a implementar nuevos y mejores procedimientos diagnósticos en donde se utilizan técnicas moleculares, entre las cuales predominan las genéticas y proteómicas, para encontrar el origen molecular de las patologías. 1,2 En particular, se considera que los estudios genéticos relacionados con ácidos nucleicos y sus mutaciones, son fundamentales y en conjunto con los estudios clínicos, han permitido el desarrollo de técnicas diagnósticas con un tiempo de respuesta reducido y nuevas terapias para evitar la expresión de patologías o para disminuir su gravedad. 4 Es preciso mencionar que la mayor parte de las muestras que se reciben en el servicio de anatomía patológica provienen de biopsias de tejidos sólidos y fluidos corporales con patologías complejas como el cáncer, enfermedad que se produce por alteraciones genéticas y epigenéticas a nivel celular, las cuales se manifiestan en los tejidos del órgano específico que se ve afectado.…”

The Dutch National TissueArchive Portal enables efficient, consistent, and transparent procurement of diagnostic tissue samples for scientific use

“…PALGA can function as a 'secondary-use' biobank of all pathological excerpts and materials, meaning that these resources were collected by pathologists with the primary goal of enabling diagnosis within a patient care setting. Importantly, pathology data and FFPE tissue samples do not only form a fundamental source for decision making on an individual patient level but can also be utilized for studying disease on a population basis (Talu et al 2020). Therefore, next to facilitating the exchange of data for healthcare, we aimed to utilize PALGA's network as an intermediate between researchers and the pathology departments to find and access a federated, national archive for requesting FFPE tissue samples for research.…”

“…PALGA can function as a ‘secondary-use’ biobank of all pathological excerpts and materials, meaning that these resources were collected by pathologists with the primary goal of enabling diagnosis within a patient care setting. Importantly, pathology data and FFPE tissue samples do not only form a fundamental source for decision making on an individual patient level but can also be utilized for studying disease on a population basis (Talu et al 2020 ).…”