A presença de animais não domiciliados no meio urbano é um fator preocupante para a saúde pública, visto que suas fezes contaminadas com formas pré-parasitárias de enteroparasitos podem atuar como meio de transmissão de diversas zoonoses, como larva migrans cutânea, larva migrans visceral, criptosporidiose e giardiase. Diante do exposto, o objetivo foi pesquisar os fatores de risco para a ocorrência de parasitos gastrintestinais de animais resgatados e acolhidos por organizações não governamentais nos municípios de Araçatuba e Birigui, São Paulo. Amostras fecais de 58 cães e 75 gatos foram colhidas e processadas por meio das técnicas de Willis-Mollay e Hoffman, Pons e Janer. A investigação dos fatores de risco foi efetuada por meio da aplicação de um questionário em forma de entrevista. Assim, 52 (39,09%) dos animais foram considerados positivos, sendo identificados Ancylostoma spp., Cystoisospora spp., Toxocara spp. e Trichuris spp., respectivamente em 12 (66,6%), 2 (11,1%) 5 (27,7%) e 4 (22,2%) dos cães. Também foi observada a presença de Ancylostoma spp. em 27 (79,41%) e Cystoisospora spp. em 13 (38,23%) dos gatos. A técnica de Willis-Mollay apresentou maior eficácia no diagnóstico de Ancylostoma spp. (74,35%) em relação à técnica de Hoffman, Pons e Janer (25,64%) nos animais. Ainda, foi a única capaz de identificar os gêneros Cystoisospora spp. e Trichuris spp. Entretanto, a técnica de Hoffman, Pons e Janer demonstrou maior êxito no diagnóstico de Toxocara spp. (80%) em relação à técnica de Willis-Mollay (20%). A análise dos dados constituiu-se de estatística interferencial (Teste Exato de Fisher), para verificar a associação dos fatores de risco com as infecções parasitárias, além da correlação entre as variáveis supramencionadas, não sendo observada diferença significativa. Por meio dos resultados obtidos, pode-se verificar a elevada prevalência de parasitos, inclusive de caráter zoonótico, em animais resgatados e acolhidos dos municípios de Araçatuba e Birigui, sendo os gêneros Ancylostoma e Cystoisospora os de maior ocorrência nos animais.