On the interactions of the receptor-binding domain of SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spike proteins with monoclonal antibodies and the receptor ACE2

Abstract

A new betacoronavirus named SARS-CoV-2 has emerged as a new threat to global health and economy. A promising target for both diagnosis and therapeutics treatments of the new disease named COVID-19 is the coronavirus (CoV) spike (S) glycoprotein. By constant-pH Monte Carlo simulations and the PROCEEDpKa method, we have mapped the electrostatic epitopes for four monoclonal antibodies and the angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) on both SARS-CoV-1 and the new SARS-CoV-2 S receptor binding domain (RBD) proteins. We also calculated free energy of interactions and shown that the S RBD proteins from both SARS viruses binds to ACE2 with similar affinities. However, the affinity between the S RBD protein from the new SARS-CoV-2 and ACE2 is higher than for any studied antibody previously found complexed with SARS-CoV-1. Based on physical chemical analysis and free energies estimates, we can shed some light on the involved molecular recognition processes, their clinical aspects, the implications for drug developments, and suggest structural modifications on the CR3022 antibody that would improve its binding affinities for SARS-CoV-2 and contribute to address the ongoing international health crisis.

COVID-19 en Latinoamérica: una revisión sistemática de la literatura y análisis bibliométrico

“…Solo se encontró un estudio que abordó los aspectos terapéuticos de la de la enfermedad y, además, aportaba, el mayor nivel de evidencia (ensayo clínico aleatorizado, doble-ciego) de todos los reportados en esta revisión (36). Cuatro investigaciones de ciencias básicas fueron publicadas en la región (37)(38)(39)(40).…”

Some opportunities for immunotherapy in coronavirus infection

“…Проблема осложняется тем, что имеющиеся МКАТ, нацеленные на SP к SARS-CoV, не всегда связываются с аналогичным белком SARS-CoV-2 Так, например, два МКАТ (m396, CR3014), способных сильно связываться с RBD SP SARS-CoV, не удалось связать со SP SARS-CoV-2, в то время как другое МКАТ (CR3022) эффективно связывалось с обоими CoV [77,97]. Дополнительные исследования позволили авторам сделать вывод о том, что в отличие от других МКАТ против SARS-CoV CR3022 распознает эпитоп, не перекрывающийся сайтом связывания SP SARS-CoV-2 с ACE2 клетки-хозяина [31,77].…”