A biotecnologia está cada vez mais presente entre os cotidianos e oferece várias possibilidades de aplicação em nossas vidas. Torna-se imperativo entender como ela está sendo abordada na Educação Científica. O presente trabalho busca compreender os âmbitos que envolvem as pesquisas em Biotecnologia apresentadas no Encontro Nacional de Pesquisa em Ensino de Ciências (ENPEC) revisando desde sua primeira edição em 1997, o que totalizam 11 edições do evento. Para o levantamento foi considerada a palavra Biotecnologia entendo sua complexidade e a processualidade que lhe são inerentes. Defendemos a abordagem dos modos de transição, intervocálicos e intermediários, tendo a cartografia como uma perspectiva rizomática e possibilidade de operador metodológico. As publicações foram exploradas através de linhas que perpassaram os títulos, palavras-chave e os resumos, de forma a acompanhar os fluxos de trabalhos publicados no ENPEC que relacionam o tema da Biotecnologia. Organizamos nosso mapa de informações por ano de publicações; programas de pós-graduação estão pesquisando/escrevendo sobre o tema e autoria. Constatamos com preocupação que o tema é incipiente na área, tendo número reduzido de 10 trabalhos que abordaram a biotecnologia. Defendemos assim, que mais pesquisas são necessárias para investigar e divulgar suas possibilidades para discutir incertezas científicas e interdisciplinaridade no Ensino de Ciências.