O sistema Mutator em cana-de-açúcar: uma análise comparativa com arroz

Abstract

IV são, na verdade, transposases domesticadas. Foram completamente seqüenciados dois clones de BAC de cana-de-açúcar, um proveniente de cada parental do híbrido (Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum), ambos contendo elementos da Classe III. Estes elementos foram caracterizados e a seqüência genômica de cana foi comparada com sua ortóloga em arroz, revelando um acúmulo de TEs nas regiões intergênicas. AbstractTransposable elements (TEs) constitute great part of eukaryote genetic material, in grasses, they comprise between 50-80% of the genome. Genome projects have significantly increased the amount of information about these elements, revealing their importance and allowing the development of new approaches for their study. The Mutator system (Mu) of maize is the most active and mutagenic plant transposon. Beyond the autonomous element, MuDR, the system comprises a very heterogeneous, in sequence and structure, set of elements, called (Feschotte et al. 2002). Apesar da origem e do papel biológico dessas seqüências móveis permanecerem desconhecidos, acredita-se que elas geram variabilidade genética e que, portanto, possuem grande importância para a plasticidade do genoma necessária à evolução (Flavell et al. 1997, Evgen´ev 2007. O efeito deletério da transposição pode ser minimizado pela manutenção de elementos em estado quiescente durante o crescimento e desenvolvimento normais da planta hospedeira. Por outro lado, a ativação desses elementos em situações de estresse aumentaria a taxa de mutação, possibilitando uma reestruturação do genoma, eventualmente aproveitada pela seleção natural de forma a melhorar a adaptação do organismo (McClintock 1956 e 1984, Wessler 1996 Os retroelementos estão divididos em dois grupos: retroelementos com LTRs (Longas Terminações Repetidas, na mesma direção) e retroelementos sem LTRs (Fig.1). O grupo com LTRs é composto de retrovírus e retrotransposons, que possuem uma organização similar. A diferença reside no fato dos retrotransposons não apresentarem, diferentemente dos retrovírus, o domínio env, que codifica uma glicoproteína capaz de formar o envelope protéico da partícula viral, conferindo assim o caráter infeccioso (Fosket 1994, Schmidt 1999. Os retrotransposons podem ainda ser separados em dois grupos, Ty1/copia e Ty3/gypsy (segundo a nomenclatura original de levedura e Drosophila), de acordo com a posição dos domínios protéicos INT e RTRNAseH dentro da poliproteína pol. Os retroelementos sem LTR se dividem em LINEs ("Long Interspersed Nuclear Elements") e SINEs ("Short Interspersed Nuclear Elements") ( Fig. 1). Os LINEs são elementos autônomos que codificam todas as enzimas necessárias para sua transposição, enquanto os SINEs, contendo apenas poucas centenas de pares de bases, são elementos defectivos que necessitam das enzimas em trans para completar seu ciclo replicativo (Smyth 1993, Schmidt 1999. Existem evidências que indicam que os SINEs parasitam a maquinaria de transposição dos LINEs (Ogiwara et al. 1999).Os transposons de plantas têm repetições terminais i...

Caracterização dos genes mustang em gramíneas com ênfase no estudo funcional em cana-de-açúcar

“…Para a amplificação da possível região promotora dos genes mustang foram desenhados iniciadores, baseados nas sequências obtidas por Saccaro-Jr (2007). Os iniciadores foram ancorados de forma que amplificassem um fragmento de aproximadamente 2000 pb a montante do início da transcrição, determinado pelo começo do cDNA, ou até a presença do gene vizinho.…”