Note: A PCR-Based Analysis of Hox Genes in an Earthworm, Eisenia andrei (Annelida: Oligochaeta)

Cho, Pyo Yun; Cho, Sung Jin; Lee, Myung Sik; Lee, Jong Ae; Tak, Eun Sik; Shin, Chuog; Choo, Jong Kil; Park, Soon Cheol; Lee, Kyu-Seok; Park, Ho-Yong; Kim, Chang-Bae

doi:10.1023/b:bigi.0000026719.28611.79

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“…About half of the lophotrochozoan phyla have never been investigated while only one species has been analyzed in Brachiopoda and Bryozoa, two species in Rotifera, and three species in Nemertea ( Table 1 ) [ 16 , 22 , 23 , 34 , 35 , 36 , 37 ]. More information is available for the three major lophotrochozoan phyla: Mollusca (about 30 species, Figure 1 , Table S1 ) [ 16 , 20 , 24 , 26 , 38 , 39 , 40 , 41 , 42 , 43 , 44 , 45 , 46 , 47 , 48 , 49 , 50 , 51 , 52 , 53 , 54 , 55 , 56 , 57 , 58 ], Annelida (about 20 species, Figure 2 , Table S2 ) [ 8 , 16 , 20 , 46 , 59 , 60 , 61 , 62 , 63 , 64 , 65 , 66 , 67 , 68 , 69 , 70 , 71 , 72 , 73 ] and Platyhelminthes (about 30 speci...…”

Section: Hox Presence In Lophotrochozoamentioning

confidence: 99%

An Overview of Hox Genes in Lophotrochozoa: Evolution and Functionality

Barucca

Canapa

Biscotti

2016

JDB

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Hox genes are regulators of animal embryonic development. Changes in the number and sequence of Hox genes as well as in their expression patterns have been related to the evolution of the body plan. Lophotrochozoa is a clade of Protostomia characterized by several phyla which show a wide morphological diversity. Despite that the works summarized in this review emphasize the fragmentary nature of the data available regarding the presence and expression of Hox genes, they also offer interesting insight into the evolution of the Hox cluster and the role played by Hox genes in several phyla. However, the number of genes involved in the cluster of the lophotrochozoan ancestor is still a question of debate. The data presented here suggest that at least nine genes were present while two other genes, Lox4 and Post-2, may either have been present in the ancestor or may have arisen as a result of duplication in the Brachiopoda-Mollusca-Annelida lineage. Spatial and temporal collinearity is a feature of Hox gene expression which was probably present in the ancestor of deuterostomes and protostomes. However, in Lophotrochozoa, it has been detected in only a few species belonging to Annelida and Mollusca.

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Section: Hox Presence In Lophotrochozoamentioning

confidence: 99%

An Overview of Hox Genes in Lophotrochozoa: Evolution and Functionality

Barucca

Canapa

Biscotti

2016

JDB

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“…Isso permite a realização de estudos comparativos de genomas ou sequências gênicas, podendose, assim, inferir dados evolutivos. A maioria dos estudos moleculares desenvolvidos em Annelida é de filogenia e se baseia no sequenciamento de genes como 5.8S, 18S, 28S, 12S, 16S rRNA (Beauchamp et al 2001, Jamieson et al 2002, subunidade I da citocromo oxidade (COI; Pop et al 2003), citocromo B (Cyt B; Bleidorn et al 2006), genes do desenvolvimento (Hox e ParaHox; Cho et al 2004, Fröbius & Seaver 2006 e fator de alongamento 1α (Kojima 1998).…”

Section: Introductionunclassified

Análise filogenética do minhocuçu Rhinodrilus alatus, Righi 1971 (glossoscolecidae: annelida) baseada em sequências dos genes de rDNA 5.8S, do espaço interno transcrito (its1) e da subunidade i da citocromo C oxidase mitocondrial.

Siqueira

Sandes

Campos³

et al. 2010

AZM

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O minhocuçu Rhinodrilus alatus Righi, 1971 é uma espécie endêmica do cerrado de Minas Gerais e tem sido explorada como isca para pesca por >70 anos. O objetivo do trabalho foi validar marcadores moleculares para estudos genético-populacionais, de filogenia e de filogeografia do minhocuçu. Os genes rRNA 5.8S, espaço interno transcrito (ITS1) e subunidade I da citocromo oxidase (COI) mitocondrial foram estudados. Foram amostrados indivíduos da espécie R. alatus (n = 53) em diferentes hábitats de Minas Gerais e da espécie R. motucu Righi, 1971 (n = 3), coletados em brejos de Goiás, no Brasil. A análise filogenética do gene do rRNA 5.8S mostrou que todas as seqüências de R. alatus, R. motucu e Eisenia fetida (Savigny, 1826) agruparam-se no mesmo clado (bootstrap = 98), sugerindo que, nestes organismos, o gene é conservado. Os clados formados a partir de seqüências de rRNA 5.8S de invertebrados disponíveis na base de dados são inconsistentes do ponto de vista evolutivo, sugerindo taxas evolutivas distintas entre diferentes espécies. Para a região do ITS1, foram obtidos 11 sítios polimórficos, gerando nove haplótipos. Os exemplares de R. motucu apresentaram o haplótipo mais freqüente dentre os R. alatus de Minas Gerais, não havendo evidências moleculares de que se tratem de espécies diferentes. Para o gene COI, de um total de 634 pb, obteve-se 185 sítios polimórficos, gerando árvores filogenéticas com topologia mais adequada, separando R. motucu de R. alatus.

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Note: A PCR-Based Analysis of Hox Genes in an Earthworm, Eisenia andrei (Annelida: Oligochaeta)

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Análise filogenética do minhocuçu Rhinodrilus alatus, Righi 1971 (glossoscolecidae: annelida) baseada em sequências dos genes de rDNA 5.8S, do espaço interno transcrito (its1) e da subunidade i da citocromo C oxidase mitocondrial.

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