Molecular Cytogenetic Diagnostics of Marker Chromosomes: Analysis in Four Prenatal Cases and Long-Term Clinical Evaluation of Carriers

Tesner, Pavel; Vlčková, Markéta; Drabova, Jana; Vseticka, Jan; Климова, А.В.; Lastuvkova, Jana; Zidovská, J; Pourová, Radka Kremlíková; Hančárová, Miroslava; Sedláček, Zdeněk; Kočárek, Eduard

doi:10.1159/000488790

Cited by 4 publications

(4 citation statements)

References 27 publications

(39 reference statements)

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…Exact identification of an sSMC is especially important in a prenatal situation and the time necessary for the diagnosis is of great importance. Utilization of a clear algorithm and diagnostic protocol is a valuable tool in the management of a prenatally detected sSMC and can prevent the unnecessary delays during the diagnostic process [35]. Regarding our case, the characterization of the marker chromosome before the molecular genetic era would not have been carried out properly and in many instances that pregnancies would have been terminated.…”

Section: Discussionmentioning

confidence: 92%

Prenatal diagnosis of a 16p11.2p11.1 mosaic small supernumerary marker chromosome (sSMC)

Tidrenczel

Tardy

Pikó

et al. 2019

Preprint

View full text Add to dashboard Cite

Background. Small supernumerary marker chromosome (sSMC) is a challenge in prenatal diagnosis. Its’ presence is associated with advanced maternal age and distinct ultrasound findings, prediction of postnatal clinical consequences and prenatal counselling is difficult. Exact characterization of an sSMC is augmented by the application of novel molecular methods such as fluorescent in situ hybridization (FISH) and array comparative genome hybridization (aCGH). Case presentation. Chorion villous sampling of a fetus of a 42-year old secundipara was carried out due to advanced maternal age and the conventional banding cytogenetic examination revealed a mosaic sSMC. Detailed prenatal ultrasound scan showed no fetal malformations. The karyotype from confirmatory amniocentesis was 47,XY,+mar[45]/46,XY. The level of mosaicism was 70% from chorionic villus and amnion cells as well. By using FISH and SNP based aCGH the exact origin of the marker was described and the final prenatal karyotype was determined as 47,XY,+mar[70].arr[GRCh38]16p11.2p11.1(31699804_35989873)x3dn/46,XY[30]. The increase in DNA dosage was 4,29 Mb affecting 20 genes with two OMIM ones (ZNF267 and TP53TG3), the SNP analysis excluded the possibility of uniparental disomy (UPD) of the chromosome. The application of the molecular cytogenetic methods allowed us the differentiate the mosaic marker chromosome from the known 16p11.2 duplication syndrome in close neighboring that is connected to developmental delay and autism spectrum disorder. The present case was identified as a harmless de novo euchromatic variant (EV) of the short arm of chromosome 16. Postnatal karyotyping from neonatal peripheral blood confirmed the presence of the marker. FISH analysis with probe D16Z2 on cultured lymphocyte and buccal smear samples revealed a 64% and 45% mosaic state of the sSMC, respectively. The precise karyotype was finally defined as 47,XY,+min(16)(:16p11.2->p11.1:)dn[64]/46,XY. Conclusions. Novel microarray methods combined with molecular cytogenetic analysis is particularly effective in the rapid and accurate diagnosis of sSMCs, especially in a prenatal situation when the exact characterization of a genomic imbalance is of utmost importance. Precise diagnosis facilitates proper genetic counseling, allows informed decision making and helps avoiding unnecessary pregnancy termination.

show abstract

Section: Discussionmentioning

confidence: 92%

Prenatal diagnosis of a 16p11.2p11.1 mosaic small supernumerary marker chromosome (sSMC)

Tidrenczel

Tardy

Pikó

et al. 2019

Preprint

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

“…Tỉ lệ gặp marker khi chẩn đoán trước sinh là 1:1340 và sau sinh là 1:2250. Sự khác biệt giữa 2 tỉ lệ này do hai nguyên nhân chính: sảy thai tự nhiên và quyết định dừng thai ở các thai mang marker bất thường [10]. Khoảng 77% marker mới phát sinh trong thời kì hình thành và phát triển phôi, còn lại 23% có tính chất gia đình, ở đó 16% có nguồn gốc từ mẹ và 7% có nguồn gốc từ bố [2,7].…”

Section: Tóm Tắtunclassified

“…Ngược lại, nếu marker chứa vùng Prader-Willi/Angelman trên nhiễm sắc thể 15 thì lại có tiên lượng kém. Hay khi marker xuất hiện cùng công thức nhiễm sắc thể 45,X có thể bệnh nhân có kiểu hình hội chứng Turner hoặc rối loạn phát triển tuyến sinh dục nhưng cũng có thể có kiểu hình bình thường [10].…”

Section: Tóm Tắtunclassified

Ứng dụng kĩ thuật lai huỳnh quang tại chỗ trong xác định nguồn gốc marker nhiễm sắc thể

Nga¹,

Quang²,

Liễu³

et al. 2022

JPRP

View full text Add to dashboard Cite

Tóm tắt: Marker nhiễm sắc thể là một dạng bất thường cấu trúc nhiễm sắc thể hiếm gặp. Đây là một mảnh nhỏ chất nhiễm sắc không xác định được bằng các kĩ thuật nhuộm băng thông thường. Việc xác định nguồn gốc marker có vai trò quan trọng trong chẩn đoán, định hướng điều trị, tiên lượng của bệnh nhân và phòng bệnh. Mục tiêu: xác định nguồn gốc các marker bằng kỹ thuật lai huỳnh quang tại chỗ. Đối tượng: các bệnh nhân có marker nhiễm sắc thể trên công thức nhiễm sắc thể trong năm 2020 tại khoa Di truyền và Sinh học Phân tử, Bệnh viện Nhi Trung ương. Phương pháp: kỹ thuật lai huỳnh quang tại chỗ sử dụng đầu dò 2 màu của hãng Abbott đánh dấu vào nhiễm sắc thể X và Y trên tiêu bản cặn tế bào sau nuôi cấy và thu hoạch. Kết quả: Trong số 3103 bệnh nhân có chỉ định phân tích công thức nhiễm sắc thể năm 2020, có 05 trường hợp phát hiện marker sau khi phân tích nhiễm sắc thể đồ. Xét nghiệm lai huỳnh quang tại chỗ cho thấy 03 marker có nguồn gốc từ nhiễm sắc thể Y, 02 marker còn lại có nguồn gốc từ nhiễm sắc thể X. Ngoài ra, kỹ thuật lai huỳnh quang tại chỗ còn cho phép xác định chính xác số lượng và tỉ lệ các dòng tế bào khác nhau trên bệnh nhân thể khảm. Các kết quả này đều được sử dụng trong điều trị bệnh nhân tại Bệnh viện Nhi Trung ương. Kết luận: Kỹ thuật lai huỳnh quang tại chỗ là một công cụ tin cậy trong việc cung cấp thêm thông tin di truyền về nguồn gốc các marker chưa rõ nguồn gốc, góp phần trong chẩn đoán, điều trị và tiên lượng bệnh cho bệnh nhân.

show abstract

“…In addition, in some cases, two copies of a chromosome of the same parent may be present in a normal cell, leading to uniparental disomy (UPD) ( Liehr and Al-rikabi, 2019 ). Finally, the presence of sSMCs with neocentromeres, complex markers resulting from chromothripsis, and multiple sSMCs in the same individual must be considered ( Tesner and Drabova, 2018 ) .…”

Section: Introductionmentioning

confidence: 99%

Cytogenomic characterization of small supernumerary marker chromosomes in patients with pigmentary mosaicism

Navarrete-Meneses,

Ochoa-Mellado,

Gutiérrez-Álvarez

et al. 2024

Front. Genet.

View full text Add to dashboard Cite

Introduction:The combination of gene content on the marker chromosome, chromosomal origin, level of mosaicism, origin mechanism (chromothripsis), and uniparental disomy can influence the final characterization of sSMCs. Several chromosomal aberrations, including sSMCs, have been observed in 30%–60% of patients with pigmentary mosaicism, and in more than 80%, chromosomal abnormalities are present in the mosaic state. In patients with pigmentary mosaicism the most representative chromosomes involved in sSMCs are 3, 5, 6, 9, 10, 13, 15, 18, 20, and X. In this study, we included the complete clinical, cytogenetic, and molecular characterization of seven patients with pigmentary mosaicism associated with the presence of SMCs of different chromosomal origins.Methods:The patients were diagnosed by the Genetics and Dermatology Department of three different hospitals. Cytogenetic and FISH analyses were performed on peripheral blood, light skin, and dark skin. FISH analysis was performed using different probes, depending on the marker chromosome description. Different array analysis was performed.Results:To date, of the seven cases studied, the chromosomal origins of six were successfully identified by FISH or array analysis. The chromosomes involved in SMCs were 6, 9, 15, and 18, X. The most frequently found was the centric minute structure.Discussion:To date, this group of seven patients constitutes the largest clinical and cytogenetically finely described study of cases with pigmentary mosaicism associated with sSMCs. Undoubtedly, analysis of the two skin types is a fundamental part of our study, as numerical differences may occur in the cell lines found in each skin type. The knowledge generated in this study will help delineate a very heterogeneous entity more accurately, and in the future, analyzing more patients with PM will likely establish a more definite association with the presence of this genetic alteration.

show abstract

Molecular Cytogenetic Diagnostics of Marker Chromosomes: Analysis in Four Prenatal Cases and Long-Term Clinical Evaluation of Carriers

Cited by 4 publications

References 27 publications

Prenatal diagnosis of a 16p11.2p11.1 mosaic small supernumerary marker chromosome (sSMC)

Prenatal diagnosis of a 16p11.2p11.1 mosaic small supernumerary marker chromosome (sSMC)

Ứng dụng kĩ thuật lai huỳnh quang tại chỗ trong xác định nguồn gốc marker nhiễm sắc thể

Cytogenomic characterization of small supernumerary marker chromosomes in patients with pigmentary mosaicism

Contact Info

Product

Resources

About