Mobile genetic elements: the agents of open source evolution

Abstract

Horizontal genomics is a new field in prokaryotic biology that is focused on the analysis of DNA sequences in prokaryotic chromosomes that seem to have originated from other prokaryotes or eukaryotes. However, it is equally important to understand the agents that effect DNA movement: plasmids, bacteriophages and transposons. Although these agents occur in all prokaryotes, comprehensive genomics of the prokaryotic mobile gene pool or 'mobilome' lags behind other genomics initiatives owing to challenges that are distinct from cellular chromosomal analysis. Recent work shows promise of improved mobile genetic element (MGE) genomics and consequent opportunities to take advantage - and avoid the dangers - of these 'natural genetic engineers'. This review describes MGEs, their properties that are important in horizontal gene transfer, and current opportunities to advance MGE genomics.

Susceptibilidad antimicrobiana en Chile 2012

“…Lamentablemente, lejos de solucionarse, este problema continúa aumentando, tanto por su incidencia, como debido a la variedad de mecanismos de resistencia descritos. Esto último se ve favorecido por la presencia de clones de alta transmisibilidad 3 y elementos genéticos móviles, que facilitan la diseminación de genes de resistencia entre las bacterias [4][5][6] . Tanta es la importancia de este problema, que en el año 2011 la OMS lo consideró como tema prioritario en el Día Mundial de la Salud 7 .…”

Actinomycete integrative and conjugative pMEA-like elements of Amycolatopsis and Saccharopolyspora decoded

“…Identification and characterisation of mobile genetic elements of Amycolatopsis strains is important for the construction and improvement of vectors for gene cloning and expression, and for the manipulation of Amycolatopsis and Saccharopolyspora strains producing important metabolites. Mobile genetic elements such as bacteriophages and the plasmid-like integrative elements that are discussed here are also of interest from the point of view of their own origin and evolution, and as effective modulators of host genome diversity (Frost et al, 2005).…”

How Does the Horizontal Gene Transfer in Bacteria Occur and Than Is It Tied Up

“…Различные этапы процесса конъюгации обслу-живаются большим арсеналом белков, функции ко-торых рассматриваются в обзорах [14,22,26,71]. Наиболее успешно ОГПГ с участием плазмид проис-ходит в условиях тесного контакта конъюгирующих партнеров, особенно в биопленках [70], ризосфере других локальных экосистемах.…”

“…перечень баз данных в обзорах [25,26]) еще недостаточно аннотирован и систематизирован, что затрудняет их классификацию, отражающую фун-кциональные характеристики геномов. Прежде все-го это относится к орфанам [76] -гипотетическим генам, которые не имеют прямых гомологов у других бактерий, но занимают много места в мобильных элементах.…”