Microbial Landscape of the Pharynx in Outpatients during the Pandemic of the New Coronavirus Infection COVID-19: A Retrospective Study

Abstract

Введение. Пандемия COVID-19 привела к значительным изменениям микрофлоры глотки у пациентов, что требует масштабных исследований на основании доказательной медицины для последующего выбора адекватной терапии. Цель. Определить микробный пейзаж у пациентов с острыми и хроническими воспалительными заболеваниями глотки в период пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 и сравнить с «доковидным» периодом. Материалы и методы. В ретроспективное исследование 2019–2022 гг. включен анализ 403 образцов отделяемого из глотки у пациентов, обратившихся на амбулаторный прием к врачу-оториноларингологу с жалобами на боль в горле с острыми воспалительными заболеваниями и обострением хронических воспалительных заболеваний глотки на фоне острых респираторных инфекций. Основную группу исследования составили 308 образцов, забранных у пациентов в период пандемии COVID-19. Группу сравнения составили 95 забранных проб при заболеваниях, развившихся при ОРВИ в 2019 г. Проведено сравнение этиологической структуры микробного пейзажа глотки у пациентов в период пандемии COVID-19 и при ОРВИ в «доковидный» период. Результаты. Микробный пейзаж глотки при различных острых заболеваниях и при обострении хронических заболеваний является постоянно меняющимся и зависит от целого ряда причин. У пациентов с болями в горле в период пандемии COVID-19 по сравнению с «доковидным» периодом отмечаются следующие особенности: частота встречаемости грамположительной флоры, преимущественно представленной S. aureus, уменьшилась практически в 2 раза, что обратно пропорционально росту грибковой коинфекции, вызванной Candida albicans (р<0,001). Грамотрицательная флора не является доминирующей в микробном пейзаже заболеваний глотки. Однако получен незначительный подъем частоты встречаемости Kl. pneumoniae до 18% в 2020 г. Выделение Enterococcus, наоборот, имело медленный, но устойчивый тренд к увеличению частоты за все время наблюдения от 5% в 2019 г. до 12% в 2022 г., что может указывать на развитие дисбиоза глотки, возникающего на фоне неадекватного лечения (р>0,05). Выводы. Новая коронавирусная инфекция COVID-19 является новым, до конца не изученным заболеванием, для которого характерны присоединение бактериальной и грибковой коинфекции, активация условно-патогенной микрофлоры и как итог – изменение микробного пейзажа заболеваний глотки. Местные антисептики не заменяют системную антибиотикотерапию, в то же время занимают важное место в лечении воспалительных заболеваний глотки ввиду своего антимикробного спектра действия, обезболивающего и противовоспалительного эффектов, что приводит к синергизму и потенцированию эффектов системной антибактериальной терапии. Introduction. The COVID-19 pandemic has led to significant changes in the microflora of the pharynx, which requires large-scale research based on evidence-based medicine for the subsequent selection of adequate therapy for patients. Purpose. To determine the microbial landscape in patients with acute and chronic inflammatory diseases of the pharynx during the pandemic of the new coronavirus infection COVID-19 and compare it with the pre-Covid period. Materials and methods. In a retrospective study from 2019–2022 included an analysis of 403 samples of pharyngeal discharge from patients who applied for an outpatient appointment with an otolaryngologist with complaints of sore throat with acute and exacerbations of chronic inflammatory diseases of the pharynx against the background of acute respiratory infections. The main study group consisted of 308 samples taken from patients during the COVID-19 pandemic. The comparison group consisted of 95 samples taken from diseases that developed as a result of ARVI in 2019. A comparison was made of the etiological structure of the microbial landscape of the pharynx in patients during the COVID-19 pandemic and with acute respiratory infections in the pre-Covid period. Results. The microbial landscape of the pharynx in various acute and exacerbation of chronic diseases is constantly changing and depends on a number of reasons. In patients with sore throat during the COVID-19 pandemic, compared to the pre-Covid period, the following features are noted: the frequency of occurrence of gram-positive flora, mainly represented by S. aureus, decreased by almost 2 times, which is inversely proportional to the increase in fungal co-infection caused by Candida albicans (p<0.001). Gram-negative flora is not dominant in the microbial landscape of pharyngeal diseases. However, a slight increase in the frequency of occurrence of Kl. pneumoniae up to 18% in 2020 was obtained. Isolation of Enterococcus, on the contrary, had a slow but steady trend towards an increase in the frequency of isolation during the entire observation period from 5% in 2019 to 12% in 2022, which may indicate the development of pharyngeal dysbiosis arising from inadequate treatment (p>0.05). Conclusions. The new coronavirus infection COVID-19 turned out to be a new, not fully understood disease, which is characterized by the addition of bacterial and fungal co-infection, activation of opportunistic microflora and, as a result, a change in the microbial landscape of the pharynx disease. Local antiseptics do not replace systemic antibiotic therapy, but at the same time they occupy an important place in the treatment of inflammatory diseases of the pharynx due to their antimicrobial spectrum of action, analgesic and anti-inflammatory effects, which leads to synergism and potentiation of the effects of systemic antibacterial therapy.