Mapeamento associativo de locos relacionados à produtividade de grãos em soja

Sigrist, Mário Sérgio

doi:10.11606/t.11.2012.tde-04012013-084610

Cited by 1 publication

(2 citation statements)

References 47 publications

Supporting

Mentioning

Contrasting

Unclassified

Order By: Relevance

“…As associações de desequilíbrio podem surgir por meio do fluxo gênico, assim ocorre o aparecimento de associações alélicas entre dois loci que não estão ligados. Estas associações decaem com o tempo e dependem da distância genética entre os grupos parentais, contudo o desequilíbrio de ligação diminui de acordo com as taxas de recombinação recorrente em várias gerações de cruzamento (Godinho, 2008;Sigrist, 2012).…”

Section: Associação Das Variantes E Sua Frequência Em Diferentes Populaçõesunclassified

See 1 more Smart Citation

Conflito de interpretação e desequilíbrio de ligação em variantes en-contradas nos genes BRCA1 e BRCA2

Grosso¹,

Moreira²,

Agostinho

2021

J. Biotechnol. Biodivers.

View full text Add to dashboard Cite

Este estudo teve como objetivo analisar variantes encontradas nos genes BRCA1 e BRCA2 com intuito de comparar as diferentes predições in silico de ferramentas distintas, além de investigar variantes candidatas à desequilíbrio de ligação (LD). Para as análises in silico foram utilizados os programas ClinVar, SIFT, PolyPhen2, VEP, PROVEAN e Fathmm-MKL. A investigação da LD foi feita pelo programa Linkage Disequilibrium Calculator. Observou-se 60 variantes distintas, predominando as trocas nucleotídicas de T>C. Os programas SIFT, PolyPhen2 e PROVEAN apresentaram semelhanças quanto ao grau de patogenicidade determinado em cada variante. O VEP, o Fathmm-MKL e o ClinVar apresentaram resultado de predição para maior parte das variantes analisadas. A partir das 16 variantes com suspeita de LD, selecionadas manualmente, foram confirmadas 33 LD quando analisadas aos pares. A combinação das variantes em LD resultou na categorização de 5 grupos. As variantes genéticas observadas em nossa amostra são encontradas com maior frequência na América, Sul da Ásia e Leste Asiático, na África e na Europa. A associação do fenótipo do paciente com seu genótipo e as informações epidemiológicas das variantes encontradas no câncer, assim como informações sobre o prognóstico e tratamento associados, podem proporcionar melhor qualidade de vida, entendimento das doenças e de fatores evolutivos associados.

show abstract

Section: Associação Das Variantes E Sua Frequência Em Diferentes Populaçõesunclassified

“…Desta forma, compreender o processo descrito e discernir a população de origem do desequilíbrio de ligação ajudará no mapeamento de genes relacionados a doenças e à evolução das populações (Sigrist, 2012).…”

Section: Associação Das Variantes E Sua Frequência Em Diferentes Populaçõesunclassified

Conflito de interpretação e desequilíbrio de ligação em variantes en-contradas nos genes BRCA1 e BRCA2

Grosso¹,

Moreira²,

Agostinho

2021

J. Biotechnol. Biodivers.

View full text Add to dashboard Cite

show abstract

Mapeamento associativo de locos relacionados à produtividade de grãos em soja

Cited by 1 publication

References 47 publications

Conflito de interpretação e desequilíbrio de ligação em variantes en-contradas nos genes BRCA1 e BRCA2

Conflito de interpretação e desequilíbrio de ligação em variantes en-contradas nos genes BRCA1 e BRCA2

Contact Info

Product

Resources

About