<p>The Phylogenetic Relatedness of <em>bla</em>N_DM-1 Harboring Extended-Spectrum β-Lactamase Producing Uropathogenic <em>Escherichia coli</em> and <em>Klebsiella pneumoniae</em> in the North of Iran</p>

Abstract

Background: Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae as an important part of Enterobacterales family are important causes of both community-and hospital-acquired infections. The present study aimed to investigate the prevalence of antibiotics resistance and molecular characteristics of uropathogenic isolates of E. coli and K. pneumoniae in Iranian patients. Methods: This cross-sectional study performed on 223 Escherichia coli and 68 Klebsiella pneumoniae isolates obtained from hospitalized patients in the north of Iran. The isolates were identified by standard microbiologic tests and confirmed by API 20E strip. Disk diffusion method was applied to determine antibiotic susceptibility pattern. The presence of β-lactamases encoding genes was evaluated by PCR method. Analysis of the mutations and homology among sequences was done by the CLC sequence viewer (Qiagen, Denmark), and phylogenetic trees were constructed by the neighbor-joining method (Bootstrap: 1000 times). Results: The overall rates of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs)-producing E. coli and K. pneumoniae isolates were 37.7% and 32.4%, respectively. The overall presence of bla SHV , bla NDM-1 , and bla OXA-1 genes was detected in 16 (5.5%), 12 (4.1%), and 48 (16.4%) of isolates, respectively. The neighbor-joining analysis for E. coli KU985246.1 strain showed that the most related bla NDM-1 sequences were from China, Singapore, UK, Thailand, and Bangladesh. While K. pneumoniae KU985245.1 strains were mostly related to bla NDM-1 sequences form Myanmar, and China. Conclusion: In summary, the remarkable rate of ESBL-producing uropathogenic Enterobacterales along with the first prevalence of NDM-1 β-lactamases can be a serious concern in our region.

Virulence characterization and clonal analysis of uropathogenic Escherichia coli metallo-beta-lactamase-producing isolates

“…In Iran bla NDM is mostly isolated from carbapenem-resistant Klebsiella isolates [ 54 , 55 ]; however, there have been reports of carbapenem-resistant E. coli isolates carrying this gene [ 53 , 57 – 58 ]. A study conducted in Ahvaz; Iran from 2014 to 2015 reported that there were no MBL-producing Enterobactericeae isolates carrying bla NDM in this region [ 59 ]. However, in 2018, this gene was found in commensal E. coli and Pseudomonas aeruginosa which indicates the dissemination of this type of resistance among bacteria in Ahvaz; Iran [ 57 , 60 ].…”

Virulence characterization and clonal analysis of uropathogenic Escherichia coli metallo-beta-lactamase-producing isolates

“…In Iran bla NDM is mostly isolated from carbapenem-resistant Klebsiella isolates [48,49]; however, there have been reports of carbapenem-resistant E. coli isolates carrying this gene. [47,[50][51][52]. A study conducted in Ahvaz; Iran from 2014 to 2015 reported that there were no MBL-producing Enterobactericeae isolates carrying bla NDM in this region [53].…”

Tình Hình Đề Kháng Kháng Sinh Của Klebsiella Pneumonia Tại Bệnh Viện Đa Khoa Trung Ương Cần Thơ

“…Trong đó, Klebsiella pneumoniae được biết đến là một căn nguyên gây bệnh nhiễm trùng thường gặp, nhưng lại có thể diễn biến rất nặng và tỷ lệ đề kháng kháng sinh cao [2], [4]. Chúng xâm nhập vào đường hô hấp và là một trong những nguyên nhân hàng đầu gây viêm phổi hoặc xâm nhập vào đường máu gây nhiễm trùng máu hoặc nhiễm trùng vết thương, nhiễm khuẩn đường tiết niệu... Sự kháng thuốc của Klebsiella pneumoniae cực kì nguy hiểm bởi vì bản thân loại vi khuẩn này có khả năng sinh được men β lactamase phổ rộng (ESBL: Extended Spectrum Beta-lactamase) [3], [6]. Men này làm biến đổi, phá hủy cấu trúc hóa học của kháng sinh, có khả năng phân giải hầu hết các loại kháng sinh thuộc nhóm β lactam, đặc biệt đối với penicillins và cephalosporins thế hệ thứ 3.…”

“…Kết quả này tương đồng với một số nghiên cứu trong nước, cũng như nghiên cứu trên thế giới. Cụ thể, nghiên cứu của tác giả Chu Thị Hải Yến (2014) [4] thực hiện tại Bệnh viện Cấp cứu Trưng Vương cho tỷ lệ Klebsiella pneumoniae sinh ESBL là 30% và nghiên cứu của các tác giả Jamali S. và cs (2020) [6] tại Bắc Iran có tỷ lệ Klebsiella pneumoniae sinh enzyme ESBL là 32,4%.…”