Le profilage ribosomique

Abstract

L’explosion du nombre de techniques basées sur le séquençage massif parallèle est actuellement en train de révolutionner l’étude des systèmes biologiques en permettant à l’expérimentateur d’avoir une vision globale des processus se déroulant à l’échelle moléculaire. Parmi ces nouvelles approches, le profilage ribosomique est un outil particulièrement puissant pour l’étude de la traduction à un niveau de détail jamais égalé auparavant. Cette technique permet notamment de cartographier très précisément la position des ribosomes sur l’ensemble des ARN messagers en cours de traduction dans la cellule à un moment donné. Dans le cas d’une infection virale, il est ainsi possible d’étudier les mécanismes souvent très complexes et encore mal compris qui sont mis en place par les virus pour assurer la production des protéines nécessaires à leur multiplication. Cette synthèse a pour but de discuter la manière dont le profilage ribosomique peut nous permettre de mieux comprendre le cycle de réplication virale, mais aussi de montrer les biais liés à la technique à prendre en compte lors de l’analyse des résultats.