El cambio de uso de la tierra con bosques nativos convertidos a la agricultura, tierras para ganadería y plantaciones de bosques exóticos es el factor principal que afecta la vegetación ribereña y las comunidades acuáticas. El objetivo de este estudio fue evaluar las respuestas del ensamblaje de macroinvertebrados acuáticos al cambio en la cobertura ribereña en el bosque protector Murocomba, Valencia, Ecuador. Se realizaron cuatro muestreos de campo en la temporada seca (junio-octubre de 2014) y cuatro en la temporada de lluvias (diciembre-abril de 2015) en tres quebradas con diferentes coberturas riparias (e.g., bosques nativos Q1-CBN, pastos para actividades agrícolas y ganaderas Q2-CAG y plantaciones forestales Q3-CPF), en las que se recolectaron muestras de macroinvertebrados acuáticos utilizando el método D-net con malla de 500 μm, y se midieron diferentes variables fisicoquímicas in situ. Para determinar la condición ecológica, se calcularon los valores del Índice Biótico de Familias de Macroinvertebrados (IBF), el Índice Ephemeroptera, Plecoptera y Trichoptera (EPT) y el Índice Biological Monitoring Working Party (BMWP/Col). La calidad del agua varió significativamente a lo largo de las estaciones, con mayores concentraciones de oxígeno en la temporada de lluvias en todas las quebradas y un mayor caudal en la quebrada con cobertura de pastos y uso agrícola y ganadero (Q2-CAG) en la temporada de lluvias. Según el IBF y el BMWP/Col, las mejores condiciones se presentaron en la quebrada con cobertura de bosque nativos (Q1-CBN), y el EPT disminuyó en la quebrada con cobertura de pastos (Q2-CAG) en la estación lluviosa. El índice de Shannon-Weaver mostró valores más altos en Q1-CBN y Q3-CPF en el período seco, y la dominancia aumentó en Q3-CPF en la temporada de lluvias. Un total de 6 583 macroinvertebrados fueron recolectados, Trichoptera fue el orden más abundante, e Hidropsychidae la familia más abundante. El orden Coleoptera mostró una mayor abundancia en Q1-CBN y Diptera en Q2-CAG, mientras que Hemiptera mostró la menor abundancia en Q3-CPF. El análisis canónico discriminante basado en la abundancia de familias de macroinvertebrados y variables ambientales separó la quebrada Q2-CAG de las quebradas Q1-CBN y Q3-CPF en ambas estaciones. Los taxones que hicieron importantes contribuciones a la varianza fueron Psephenidae, Chironomidae, Leptophlebiidae, Veliidae, Simuliidae, Baetidae y Leptohyphidae, que se asociaron con los valores más altos de sólidos disueltos y pH, así como valores más altos de IBF y valores más bajos de los índices EPT, BMWP y profundidad del canal en Q2-CAG, mientras que Leptoceridae, Elmidae, Ptilodactylidae y Philopotamidae, se asociaron con valores más altos de EPT y BMWP y con mayor profundidad en Q1-CBN y Q3-CPF. Se evidenció una influencia negativa de las actividades antrópicas en las variables fisicoquímicas y la estructura del ensamblaje de macroinvertebrados. Esto indica que la vegetación ribereña es un factor determinante para el establecimiento y la estructura de las comunidades acuáticas.