A pesquisa teve como objetivo selecionar primers microssatélites SSR do gênero Copernicia para estudos da estrutura genética de Copernicia alba, uma espécie da palmeira que é encontada em regiões menos alagadas do Pantanal sul mato-grossense. Foram coletados 25 individuos de C.alba de uma população localizada entre a zona urbana de Cáceres e a Estação Ecológica de Taiamã (ESESC-Taiamã). Sendo selecionados 17 marcadores moleculares SSR, inicialmente desenhados para Copernicia prunifera, e testados com DNA extraído das amostras de folhas. Após a coleta do material foi realizada a maceração para a extração do DNA gênomico seguindo protocolo PROMEGA, e testados usando o kit Qubit™ dsDNA BR Assay. O estudo identificou primers microssatélites capazes de amplificar e reproduzir bandas visíveis. Sendo 11 dos 17 marcadores testados para C.alba tiveram sucesso de transferência. A utilização desses marcadores moleculares é fundamental para o desenvolvimento de práticas de manejo da conservação de um corredor ecológico, na manutenção da diversidade genética e do fluxo gênico especialmente em ambientes únicos como o Pantanal.