Investigation into the efficacy of geospatial big data visualization tools

Barik, Rabindra K.; Lenka, Rakesh Kumar; Ali, Syed Mohd; Gupta, Neelesh; Satpathy, Ananya; Raj, Aditya

doi:10.1109/ccaa.2017.8229777

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“…Monthly mean temperature rasters at a 30 s spatial resolution were downloaded from the WorldClim‐Global Climate Data project (Fick & Hijmans, 2017) using the raster package (Hijmans, 2021) in the R environment (R Development Core Team, 2017). We cropped the temperature raster maps to the Africa and Asia continents using the Crop function from the raster package in ArcMap 10.8.1 (Barik et al, 2017).…”

Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Temperature impacts the environmental suitability for malaria transmission by Anopheles gambiae and Anopheles stephensi

Villena

Ryan

Murdock

et al. 2022

Ecology

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Extrinsic environmental factors influence the spatiotemporal dynamics of many organisms, including insects that transmit the pathogens responsible for vector-borne diseases (VBDs). Temperature is an especially important constraint on the fitness of a wide variety of ectothermic insects. A mechanistic understanding of how temperature impacts traits of ectotherms, and thus the distribution of ectotherms and vector-borne infections, is key to predicting the consequences of climate change on transmission of VBDs like malaria. However, the response of transmission to temperature and other drivers is complex, as thermal traits of ectotherms are typically nonlinear, and they interact to determine transmission constraints. In this study, we assess and compare the effect of temperature on the transmission of two malaria parasites, Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax, by two malaria vector species, Anopheles gambiae and Anopheles stephensi. We model the nonlinear responses of temperature dependent mosquito and parasite traits (mosquito development rate, bite rate, fecundity, proportion of eggs surviving to adulthood, vector competence, mortality rate, and parasite development rate) and

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Section: Methodsmentioning

confidence: 99%

Temperature impacts the environmental suitability for malaria transmission by Anopheles gambiae and Anopheles stephensi

Villena

Ryan

Murdock

et al. 2022

Ecology

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“…We cropped the temperature raster maps to the Africa and Asia continents using the Crop function from the raster package and assigned values of one and zero depending on whether the probability of S(T ) >0 exceeded the threshold at the temperature in those cells. Maps were created in ArcMap 10.7.1 (Barik et al, 2017;Green et al, 2017).…”

Section: Mapping Temperature Suitability For Malaria Transmissionmentioning

confidence: 99%

Temperature impacts the transmission of malaria parasites byAnopheles gambiaeandAnopheles stephensimosquitoes

Villena

Ryan

Murdock

et al. 2020

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Transmission of malaria and other vector-borne diseases (VBDs) is greatly influenced by environmental factors, especially temperature, due to the ectothermic nature of insect and arthropod vectors. However, the response of transmission to temperature and other drivers is complex, as thermal traits of ectotherms are typically non-linear, and they interact to determine transmission constraints. In this study, we assess and compare the effect of temperature on the transmission of two malaria parasites, Plasmodium falciparum and Plasmodium vivax, by two malaria vector species, Anopheles gambiae and Anopheles stephensi. We model the non-linear responses of temperature dependent mosquito and parasite traits (mosquito development rate, bite rate, fecundity, egg to adult survival, vector competence, mortality rate, and parasite development rate) and incorporate these traits into a suitability metric based on a model for the basic reproductive number across temperatures. Our model predicts that the optimum temperature for transmission suitability is similar for the four mosquito-parasite combinations assessed in this study. The main differences are found at the thermal limits. More specifically, we found significant differences in the upper thermal limit between parasites spread by the same mosquito (An. stephensi) and between mosquitoes carrying P. falciparum. In contrast, at the lower thermal limit the significant differences were primarily between the mosquito species that both carried the same pathogen (e.g., An. stephensi and An. gambiae both with P. falciparum). Using prevalence data from Africa and Asia, we show that the transmission suitability metric S(T) calculated from our mechanistic model is an important predictor of malaria prevalence. We mapped risk to illustrate the areas in Africa and Asia that are suitable for malaria transmission year-round based temperature. The wider thermal range of transmission by An. stephensi for both malaria parasites allows for a greater geographic potential for malaria spread. This study could be useful in planing preventive strategies for areas where malaria outbreaks might occur.

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“…Los datos geoespaciales ya han excedido la capacidad de almacenamiento y ahora se considera un problema de Big data, el documento [13] presenta una investigación referente al análisis crítico de las herramientas Whitebox GAT, ArcMap, GeoMesa, HadoopViz y GRASS GIS, diseñadas especialmente para la visualización de datos geoespaciales considerando la posibilidad de encontrar patrones y relaciones en los datos, únicamente, con la visualización de los mismos.…”

Section: Herramientas Software Para La Visualización De Datos Geoespacialesunclassified

“…Es importante resaltar que el insumo de entrada para un sistema inteligente corresponde a grandes volúmenes de datos estructurados, semiestructurados y/o no estructurados, provenientes de sensores remotos, datos geoespaciales, redes de información, flujos de datos, la web, entre otros, que deberán ser procesados y analizados para la visualización de los resultados [10]. En los últimos años se han producido investigaciones que podrían ayudar en este proceso y como ejemplos, el documento [11] propone un lenguaje de consulta para permitir el procesamiento de consultas espacio-temporales en flujos de datos semánticos generados a partir de diversos sensores; la referencia en [12], utiliza un estudio de caso de datos de ciudades para resolver el problema heterogéneo en diferentes fuentes mejorando la agregación, integración y representación de los datos; el estudio en [13], realiza un análisis crítico de las herramientas para visualización de información a partir de grandes volúmenes de datos geoespaciales.…”

Section: Introductionunclassified

Revisión sistemática sobre geolocalización automática para pequeñas centrales hidroeléctricas

Palacios¹,

Bucheli²,

Ordóñez

2020

Investig. innov. ing

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Objetivo: Identificar tecnologías computacionales que se están utilizando en la identificación y selección automática de sitios para pequeñas centrales hidroeléctricas. Metodología: Se realizaron búsquedas sistemáticas de artículos científicos, artículos de conferencias, revistas indexadas y libros de ingeniería, en bases de datos de referencias bibliográficas, lo que permitió, una revisión exploratoria y analítica para la recopilación de información significativa, sobre las tecnologías utilizadas en la ubicación automática de este tipo de proyectos. Resultados: Esta revisión permitió establecer que el Big Data para el análisis de datos geoespaciales, los algoritmos de agrupamiento, las metodologías de toma de decisiones con múltiples criterios y el análisis visual de datos, están directamente involucrados en la ubicación automática de pequeñas centrales hidroeléctricas. Conclusiones: En Latinoamérica se pueden encontrar algunas investigaciones alrededor de la selección automática de sitios para pequeñas centrales hidroeléctricas, sin embargo, Colombia aún no ha publicado estudios de este tipo en las principales revistas científicas y bases de datos de referencias bibliográficas, asimismo, menos del 10% de los artículos examinados en esta investigación, se han realizado en esta región del continente.

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Investigation into the efficacy of geospatial big data visualization tools

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Temperature impacts the environmental suitability for malaria transmission by Anopheles gambiae and Anopheles stephensi

Temperature impacts the environmental suitability for malaria transmission by Anopheles gambiae and Anopheles stephensi

Temperature impacts the transmission of malaria parasites byAnopheles gambiaeandAnopheles stephensimosquitoes

Revisión sistemática sobre geolocalización automática para pequeñas centrales hidroeléctricas

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