O objetivo deste estudo é avaliar o impacto da atividade de dragagem de aprofundamento do Porto de Aratu, na Baía de Todos os Santos, sobre a biomassa de plâncton. As amostras foram coletadas antes, durante e depois da dragagem, em 6 estações de amostragem, durante as marés enchente e vazante, somente no período seco.O plâncton foi coletado utilizando redes de malha 50μm (microfitoplâncton), 200μm (mesozooplâncton) e 500μm (ictioplâncton), através de arrastos horizontais de subsuperfície. As variáveis oceanográficas (temperatura e salinidade), qualidade da água (oxigênio dissolvido e turbidez) e nutrientes (amôniaefósforo total) foram obtidas simultaneamente. Durante o período de dragagem foram registrados os maiores valores de densidade demicrofitoplâncton,densidade de mesozooplâncton e peso orgânico de mesozooplâncton, além dos menores valores de ovos e larvas de peixes, que foram restabelecidos após a dragagem. A análise de ordenação multivariada mostrou uma nítida separação entre os períodos de amostragem, demonstrando variabilidade temporal nabiomassa de plâncton no porto de Aratu, em resposta a sazonalidade das características oceanográficas da massa de água e mudanças na qualidade de água, possivelmente associada com as atividades de dragagem. Palavras-chave: variáveis oceanográficas, qualidade da água, nutrientes, plâncton