Stagonospora sp. (4/99-1) is a beneficial endophytic fungus frequently transmitted by seeds of Phragmites australis [Cav.] Trin. ex Steudel. Here we show that this fungus also penetrates the root epidermis. At first, hyphae were attracted by the root and proliferated on the root surface, preferably over the anticlinal walls. Penetration occurred directly by undifferentiated hyphae or was facilitated by hyphopodia. Hyphal growth within the root was restricted to the walls of epidermal cells and the walls of the cells of the outermost cortical layer. Deeper growth by the fungus elicited wall appositions and ingress into the cytoplasm of cortical cells was blocked by papillae. In the rare cases, the fungus managed to penetrate into cortical cells, these reacted with necrosis. Immunological studies suggested that fungal material reached the host plasmalemma and may have been taken up by endocytotic events. Our observations explain the endophytic lifestyle of hyphae close to the epidermis and the restricted development within the cortex.Key words: Stagonospora, Phragmites australis, infection, root cortex, root epidermis.Résumé : Le Stagonospora sp. (4/99-1) est un champignon endophyte bénéfique, très souvent transmis par les semences du Phragmitis australis [Cav.] Trin. ex Steudel. On démontre ici que ce champignon pénètre également l'épiderme racinaire. Au départ, les hyphes sont attirées par la racine et prolifèrent sur la surface racinaire, préférablement sur les parois anticlines. La pénétration s'effectue directement par des hyphes indifférenciées, ou est facilitée par un hyphopode. La croissance de l'hyphe dans la racine est limitée aux parois des cellules épidermiques et de la couche corticale la plus externe. Une croissance plus en profondeur du champignon élicite des appositions pariétales et la pénétration dans le cytoplasme des cellules corticales est bloquée par des papilles. Dans les rares cas où le champignon s'est infiltré jusque dans les cellules corticales, celles-ci ont réagi avec une nécrose. Des essais immunologiques suggèrent que le matériel fongique atteint la plasmalemme de l'hôte, et pourrait été impliqué dans des évènement endocytotiques. Ces observations expliquent le mode de vie endophyte des hyphes à proximité de l'épiderme et le développement restreint dans le cortex.