Identification of citrus expressed sequence tags (ESTs) encoding pleiotropic drug resistance (PDR)-like proteins

Abstract

Pleiotropic drug resistance (PDR) proteins, a subfamily of the ATP-binding cassette (ABC) transporters, have been recently shown to play a role in plant defense against biotic and abiotic stresses. However, nothing is known about their expression in citrus. To investigate the occurrence of PDR homologues in citrus species, we have surveyed EST sequences from different tissues and conditions of the Citrus Expressed Sequence Tags (CitEST) database, through sequence similarity search analyses and inspections for characteristic PDR domains. Multiple sequence alignments, prediction of transmembrane topology and phylogenetic analysis of PDR-like proteins were additionally performed. This study allowed the identification of nine putative proteins showing characteristic PDR features in citrus species under various conditions, which may indicate a potential correlation between PDRs and stress and metabolism of citrus plants. Moreover, a tissue-specific putative PDR-like protein was found in sweet orange fruits. To our knowledge, this is the first report regarding the identification of citrus ESTs encoding PDR-like proteins as well as the first to identify a putative full ABC transporter with specific expression in fruits.

ETIQUETAS DE SECUENCIAS EXPRESADAS DIFERENCIALES DE FRUTOS DE AGUACATE RAZA MEXICANA (Persea americana Mill. var. drymifolia)

“…Varios miembros de estos genes PDR se expresan en órganos reproductivos como las flores, aunque este hecho sustenta la función de defensa de los genes, existe la hipótesis de que son responsables del transporte de fragancias florales durante el proceso de polinización (NURUZZAMAN et al, 2014). A pesar de que no hay reportes de la función de las PDR en el proceso de maduración del fruto, se ha reportado la presencia de una PDR en frutos de cítricos dulces (Citrus sinensis), para conocer su función bajo condiciones específicas, será necesario realizar nuevas investigaciones a futuro (AMARAL et al, 2007). Vitis vinifera se caracteriza porque presenta estilbenos, hidrocarburos aromáticos que están relacionados a flavonoides y que son sintetizados por grupos de plantas que no tienen relación entre ellas como Vitis, Arachis hypogaea y Pinus sylvestris, por lo que parece que diferentes ramas de esta ruta biosintética han cambiado o se han perdido durante la evolución (WINKLEY-SHIRLEY, 2001).…”