Identificação de xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e x. axonopodis pv. phaseoli var. fuscans através da técnica de pcr

Abstract

Este trabalho teve por objetivo verificar a viabilidade de utilização da técnica de PCR, usando primers considerados específicos, para identificação de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) e X. axonopodis pv. phaseoli var. fuscans (Xapf), visando criar bases para sua utilização em diagnose rotineira e em programas de certificação de sementes. Foram incluídos no estudo 42 isolados da bactéria provenientes de locais distintos, além de outros gêneros, espécies e patovares, para ser verificada a especificidade dos primers. Os resultados obtidos permitem concluir que os primers utilizados são adequados para identificação de Xap e Xapf, embora dois isolados patogênicos não tenham sido amplificados. Foi observada também a amplificação de uma banda fraca para X. axonopodis pv. vitians, com o mesmo número de pares de bases, o que sugere existir homologia entre estes patovares, na região amplificada.Palavras-chave adicionais: Phaseolus vulgaris, crestamento bacteriano do feijoeiro, caracterização molecular.The objective of this study was to determine the availability of PCR technique as a tool for Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) and X. axonopodis pv. phaseoli var. fuscans (Xapf) identification. The specificity of the primers was tested based on the DNA amplification of 42 isolates of bacteria collected at several locations. The primers were capable of identifying Xap and Xapf, although two virulent isolates were not detected. The amplification of a weak band, which was observed for X. axonopodis pv. vitians, suggests homology between these pathovars, in the same region. ABSTRACTIdentification of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli and X. axonopodis pv. phaseoli var. fuscans through the PCR technique INTRODUÇÃO

Comparison of techniques for DNA extraction and agarose gel staining of DNA fragments using samples of Cryptosporidium

“…Low annealing temperatures can produce non-specific products. This problem is solved using higher temperatures; however, the amount of product obtained from the PCR is also reduced (Halfeld-Vieira et al 2001).…”

Detection of Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli and Pseudomonas savastanoi pv. Phaseolicola on bean seed using a Milk-tween medium

“…Mnogi autori ističu da je standardne procedure za dokazivanje patogena na semenu potrebno dopunjavati serološkim i molekularnim metodama (Audy et al 1994, Halfeld-Vieira et al 2001. Van Vuurde et al (1983) navode mogućnost primene IF i ELISA testova kao potencijalnih rutinskih testova za detekciju Psp i Xap na semenu pasulja.…”

“…Prema rezultatima DAS i PTA ELISA testova, utvrđeno je da su svi ispitivani izolati reagovali sa specifičnim antitelima. Rezultati PCR-a su pokazali da je došlo do amplifikacije fragmenata nukleinske kiseline veličine 730 bp kod bakterije Xap i 450 bp kod bakterije Psp, što navode i drugi autori (Schaad et al 2001, Halfeld-Vieira et al 2001.Mnogi autori ističu da je standardne procedure za dokazivanje patogena na semenu potrebno dopunjavati serološkim i molekularnim metodama (Audy et al 1994, Halfeld-Vieira et al 2001. Van Vuurde et al (1983) navode mogućnost primene IF i ELISA testova kao potencijalnih rutinskih testova za detekciju Psp i Xap na semenu pasulja.…”

“…Prema rezultatima DAS i PTA ELISA testova, utvrđeno je da su svi ispitivani izolati reagovali sa specifičnim antitelima. Rezultati PCR-a su pokazali da je došlo do amplifikacije fragmenata nukleinske kiseline veličine 730 bp kod bakterije Xap i 450 bp kod bakterije Psp, što navode i drugi autori (Schaad et al 2001, Halfeld-Vieira et al 2001. …”

Agressividade de linhagens de Xanthomonas axonopodis pv. aurantifolii Tipo C em lima ácida 'Galego'

“…phaseoli produtoras e não produtoras de pigmento podem formar grupos distintos com variabilidade sorológica (Maringoni et al, 1994;Oleas-Arias, 1982) e variações nos perfis gerados por PCR (Halfeld-Vieira et al, 2001) e RAPD (Birch et al, 1997). Com relação às linhagens de Xaa-C produtoras e não produtoras de pigmento, os estudos iniciais realizados com 20 linhagens (Destéfano & Rodrigues Neto, 2001) revelaram uniformidade entre as linhagens por meio de caracterização molecular baseada no polimorfismo da região espaçadora 16S-23S, e, aparentemente, não mostraram diferenças em patogenicidade à lima ácida 'Galego'.…”