Pesq. Vet. Bras. 31(9):798-805, setembro 2011 RESUMO.-[Coccídios isosporóides (Apicomplexa: Eimeriidae) parasitos de traupídeos (Passeriformes: Thraupidae) da ilha de Marambaia, Brasil.] Nos últimos anos, alguns coccídios de aves foram registrados na Ilha da Marambaia, que é um ambiente protegido com uma grande biodiversidade de aves, principalmente traupídeos. No presente estudo Isospora tiesangui, I. sepetibensis, I. ramphoceli, I. navarroi, I. cadimi e I. marambaiensis foram identificadas de acordo com suas respectivos hospedeiros da Ilha da Marambaia, RJ. Essas espécies foram caracterizadas com histogramas, regressão linear e análi-se de variância (ANOVA). A principal característica de identificação foi a morfologia do esporocisto, principalmente os corpos de stieda e substieda, uma vez que a morfometria não forneceu diferenciação suficiente. Além disso, Dacnis cayana e Thraupis palmarum foram registrados como novos hospedeiros para I. sepetibensis e I. navarroi respectivamente.